当前蛋白身份:P22001 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4BGC T1 domain of the renal potassium channel Kv1.3 提交 2013-03-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 104–204(101 aa) 片段:T1 DOMAIN, RESIDUES 104-204
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;WE WANTED TO USE THE PROTEIN IN 150 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 6.5 IN 5 MM NMR TUBES FOR CHARACTERIZATION USING NMR SPECTROSCOPY. DURING TESTING, WE OBSERVED THE FORMATION OF CRYSTALS IN THE NMR TUBES. AN INITIAL TEST OF THE CRYSTALS SHOWED AN EXCELLENT DIFFRACTION PATTERN, SO WE DECIDED TO CONTINUE WITH CRYSTALLIZATION OPTIMIZATION IN NMR TUBES, RESULTING IN VERY GOOD CRYSTALS
分辨率 1.20 Å R-free 0.205
7EJ1 human voltage-gated potassium channel KV1.3 提交 2021-04-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
链 F 1–575(575 aa)
链 H 1–575(575 aa)
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7EJ2 human voltage-gated potassium channel KV1.3 H451N mutant 提交 2021-04-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
链 F 1–575(575 aa)
链 H 1–575(575 aa)
突变:H451N 突变:H451N 突变:H451N 突变:H451N NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7SSV Structure of human Kv1.3 with Fab-ShK fusion 提交 2021-11-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
7SSX Structure of human Kv1.3 提交 2021-11-11 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7SSY Structure of human Kv1.3 (alternate conformation) 提交 2021-11-11 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7SSZ Structure of human Kv1.3 with A0194009G09 nanobodies 提交 2021-11-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7WF3 Composite map of human Kv1.3 channel in apo state with beta subunits 提交 2021-12-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 208–493(286 aa) 片段:TM domain
链 D 208–493(286 aa) 片段:TM domain
链 F 208–493(286 aa) 片段:TM domain
链 H 208–493(286 aa) 片段:TM domain
链 J 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
链 N 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
链 O 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
链 P 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
未记录 K POTASSIUM ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WF4 Composite map of human Kv1.3 channel in dalazatide-bound state with beta subunits 提交 2021-12-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 208–490(283 aa) 片段:TM domain
链 D 208–490(283 aa) 片段:TM domain
链 F 208–490(283 aa) 片段:TM domain
链 H 208–490(283 aa) 片段:TM domain
链 J 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
链 N 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
链 O 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
链 P 99–204(106 aa) 片段:T1 domain
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8DFL Structure of human Kv1.3 with A0194009G09 nanobodies (alternate conformation) 提交 2022-06-22 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9CLA Human Kv1.3 mutant-H451V 提交 2024-07-10 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9CLV Human Kv1.3 mutant-P424G 提交 2024-07-12 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
9CON Human Kv1.3-H451V with A0194009G09 nanobodies conformation 1 提交 2024-07-17 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9CTY Human Kv1.3-H451V with A0194009G09 nanobodies conformation 2 提交 2024-07-25 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
9EEF Human Kv1.3 mutant - G427H 提交 2024-11-19 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
突变:G427H 突变:G427H 突变:G427H 突变:G427H K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9EI0 Human Kv1.3 mutant - G427H with A0194009G09 nanobodies 提交 2024-11-25 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–575(575 aa)
链 B 1–575(575 aa)
链 C 1–575(575 aa)
链 D 1–575(575 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å