当前蛋白身份：P22290
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3RRC Crystal Structure of Region II from Plasmodium vivax Duffy Binding Protein 提交 2011-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
211–525（315 aa）
片段：Region II (UNP residues 211-525)
链 B
211–525（315 aa）
片段：Region II (UNP residues 211-525)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；0.1 M ammonium phosphate, 23% polyethylene glycol 3350, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.241 |
| 4NUU Heterotrimer structure of Region II from Plasmodium vivax Duffy Binding Protein (PvDBP) bound to the ectodomain of the Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC) 提交 2013-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
211–525（315 aa）
片段：unp residues 211-525
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；290 K；0.1 M HEPES and 20% (w/v) polyethylene glycol 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 7.4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.202 |
| 4NUU Heterotrimer structure of Region II from Plasmodium vivax Duffy Binding Protein (PvDBP) bound to the ectodomain of the Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC) 提交 2013-12-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
211–525（315 aa）
片段：unp residues 211-525
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；290 K；0.1 M HEPES and 20% (w/v) polyethylene glycol 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 7.4
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.202 |
| 4NUV Heterotetramer structure of Region II from Plasmodium vivax Duffy Binding Protein (PvDBP) bound to the ectodomain of the Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC) 提交 2013-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
211–525（315 aa）
片段：unp residues 211-525
链 B
211–525（315 aa）
片段：unp residues 211-525
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未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；290 K；0.1 M HEPES and 20% (w/v) polyethylene glycol 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 7.4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.233 |
| 4NUV Heterotetramer structure of Region II from Plasmodium vivax Duffy Binding Protein (PvDBP) bound to the ectodomain of the Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC) 提交 2013-12-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
211–525（315 aa）
片段：unp residues 211-525
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；290 K；0.1 M HEPES and 20% (w/v) polyethylene glycol 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 7.4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.233 |
| 4NUV Heterotetramer structure of Region II from Plasmodium vivax Duffy Binding Protein (PvDBP) bound to the ectodomain of the Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC) 提交 2013-12-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
211–525（315 aa）
片段：unp residues 211-525
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；290 K；0.1 M HEPES and 20% (w/v) polyethylene glycol 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 7.4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.233 |
| 4YFS Structure of the synthetic Duffy Binding Protein (DBP) antigen DEKnull relevant for malaria vaccine design 提交 2015-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
198–521（324 aa）
片段：UNP RESIDUES 198-521
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M di-sodium tartrate, 20% PEG 3350, and microseeded into 0.2 M lithium chloride, 20% PEG 3350
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分辨率 2.10 Å R-free 0.259 |
| 5F3J Crystal structure of DBP in complex with inhibitory monoclonal antibody 2D10 提交 2015-12-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
211–525（315 aa）
片段：UNP residues 211-525
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；1% w/v tryptone, 50 mM HEPES sodium salt pH 7.0, 12% w/v PEG 3,350
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分辨率 4.00 Å R-free 0.300 |
| 5F3J Crystal structure of DBP in complex with inhibitory monoclonal antibody 2D10 提交 2015-12-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
211–525（315 aa）
片段：UNP residues 211-525
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；1% w/v tryptone, 50 mM HEPES sodium salt pH 7.0, 12% w/v PEG 3,350
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.300 |
| 6R2S The structure of Plasmodium vivax Duffy binding protein (PvDBP) bound to human antibody DB9 提交 2019-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
211–508（298 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；45 % v/v polypropylene glycol 400, 10% v/v ethanol
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分辨率 3.04 Å R-free 0.238 |
| 9EZE Structure of subdomain 3 of the Plasmodium vivx Duffy binding protein (PvDBP) bound to human antibody DB9 提交 2024-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
211–508（298 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate pH 4.0, 15% PEG 4000
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分辨率 1.55 Å R-free 0.223 |
| 9EZE Structure of subdomain 3 of the Plasmodium vivx Duffy binding protein (PvDBP) bound to human antibody DB9 提交 2024-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
211–508（298 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate pH 4.0, 15% PEG 4000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.223 |