当前蛋白身份：P22535
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CJD THE BACTERIOPHAGE PRD1 COAT PROTEIN, P3, IS STRUCTURALLY SIMILAR TO HUMAN ADENOVIRUS HEXON 提交 1999-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.2；35% (W/V) MPD, 0.2 M NACL, 0.1 M SODIUM ACETATE, PH 4.2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.205 |
| 1GW7 QUASI-ATOMIC RESOLUTION MODEL OF BACTERIOPHAGE PRD1 CAPSID, OBTAINED BY COMBINED CRYO-EM AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY. 提交 2002-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 720 PDB 声明：720-MERIC（720） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.50 Å |
| 1GW7 QUASI-ATOMIC RESOLUTION MODEL OF BACTERIOPHAGE PRD1 CAPSID, OBTAINED BY COMBINED CRYO-EM AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY. 提交 2002-03-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.50 Å |
| 1GW7 QUASI-ATOMIC RESOLUTION MODEL OF BACTERIOPHAGE PRD1 CAPSID, OBTAINED BY COMBINED CRYO-EM AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY. 提交 2002-03-08 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.50 Å |
| 1GW7 QUASI-ATOMIC RESOLUTION MODEL OF BACTERIOPHAGE PRD1 CAPSID, OBTAINED BY COMBINED CRYO-EM AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY. 提交 2002-03-08 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.50 Å |
| 1GW7 QUASI-ATOMIC RESOLUTION MODEL OF BACTERIOPHAGE PRD1 CAPSID, OBTAINED BY COMBINED CRYO-EM AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY. 提交 2002-03-08 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.50 Å |
| 1GW8 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus607 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2002-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 720 PDB 声明：720-MERIC（720） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.30 Å |
| 1GW8 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus607 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2002-03-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.30 Å |
| 1GW8 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus607 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2002-03-08 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.30 Å |
| 1GW8 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus607 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2002-03-08 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.30 Å |
| 1GW8 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus607 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2002-03-08 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.2；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 13.30 Å |
| 1HB5 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 P3-shell, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 540 PDB 声明：540-MERIC（540） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 12.00 Å |
| 1HB5 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 P3-shell, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 12.00 Å |
| 1HB5 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 P3-shell, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-11 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric（45） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 12.00 Å |
| 1HB5 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 P3-shell, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-11 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 12.00 Å |
| 1HB5 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 P3-shell, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-11 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 12.00 Å |
| 1HB7 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus1 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 720 PDB 声明：720-MERIC（720） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 14.00 Å |
| 1HB7 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus1 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 14.00 Å |
| 1HB7 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus1 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 14.00 Å |
| 1HB7 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus1 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-12 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 14.00 Å |
| 1HB7 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 sus1 mutant, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-12 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 14.00 Å |
| 1HB9 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 wild type virion, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 720 PDB 声明：720-MERIC（720） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 25.00 Å |
| 1HB9 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 wild type virion, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 25.00 Å |
| 1HB9 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 wild type virion, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-13 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 25.00 Å |
| 1HB9 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 wild type virion, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-13 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 25.00 Å |
| 1HB9 quasi-atomic resolution model of bacteriophage PRD1 wild type virion, obtained by combined cryo-EM and X-ray crystallography. 提交 2001-04-13 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
链 D
1–394（394 aa）
链 E
1–394（394 aa）
链 F
1–394（394 aa）
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
链 I
1–394（394 aa）
链 J
1–394（394 aa）
链 K
1–394（394 aa）
链 L
1–394（394 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGE VITRIFICATION
|
分辨率 25.00 Å |
| 1HQN THE SELENOMETHIONINE DERIVATIVE OF P3, THE MAJOR COAT PROTEIN OF THE LIPID-CONTAINING BACTERIOPHAGE PRD1. 提交 2000-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；298 K；30% MPD, 0.2 M NACL, 0.1 M SODIUM ACETATE, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 1HX6 P3, THE MAJOR COAT PROTEIN OF THE LIPID-CONTAINING BACTERIOPHAGE PRD1. 提交 2001-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–394（394 aa）
链 B
1–394（394 aa）
链 C
1–394（394 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 7 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；298 K；30% MPD, 0.1 M sodium acetate, 0.2 M NaCl, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.208 |
| 1W8X Structural analysis of PRD1 提交 2004-10-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 900 PDB 声明：900-MERIC（900） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
链 B
1–395（395 aa）
链 C
1–395（395 aa）
链 D
1–395（395 aa）
链 E
1–395（395 aa）
链 F
1–395（395 aa）
链 G
1–395（395 aa）
链 H
1–395（395 aa）
链 I
1–395（395 aa）
链 J
1–395（395 aa）
链 K
1–395（395 aa）
链 L
1–395（395 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；3.7 W/V PEG 8000, 400 MM NACL 100 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 7.2
|
分辨率 4.20 Å |
| 1W8X Structural analysis of PRD1 提交 2004-10-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
链 B
1–395（395 aa）
链 C
1–395（395 aa）
链 D
1–395（395 aa）
链 E
1–395（395 aa）
链 F
1–395（395 aa）
链 G
1–395（395 aa）
链 H
1–395（395 aa）
链 I
1–395（395 aa）
链 J
1–395（395 aa）
链 K
1–395（395 aa）
链 L
1–395（395 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；3.7 W/V PEG 8000, 400 MM NACL 100 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 7.2
|
分辨率 4.20 Å |
| 1W8X Structural analysis of PRD1 提交 2004-10-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：75-meric（75） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
链 B
1–395（395 aa）
链 C
1–395（395 aa）
链 D
1–395（395 aa）
链 E
1–395（395 aa）
链 F
1–395（395 aa）
链 G
1–395（395 aa）
链 H
1–395（395 aa）
链 I
1–395（395 aa）
链 J
1–395（395 aa）
链 K
1–395（395 aa）
链 L
1–395（395 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；3.7 W/V PEG 8000, 400 MM NACL 100 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 7.2
|
分辨率 4.20 Å |
| 1W8X Structural analysis of PRD1 提交 2004-10-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：90-meric（90） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
链 B
1–395（395 aa）
链 C
1–395（395 aa）
链 D
1–395（395 aa）
链 E
1–395（395 aa）
链 F
1–395（395 aa）
链 G
1–395（395 aa）
链 H
1–395（395 aa）
链 I
1–395（395 aa）
链 J
1–395（395 aa）
链 K
1–395（395 aa）
链 L
1–395（395 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；3.7 W/V PEG 8000, 400 MM NACL 100 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 7.2
|
分辨率 4.20 Å |
| 1W8X Structural analysis of PRD1 提交 2004-10-01 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
链 B
1–395（395 aa）
链 C
1–395（395 aa）
链 D
1–395（395 aa）
链 E
1–395（395 aa）
链 F
1–395（395 aa）
链 G
1–395（395 aa）
链 H
1–395（395 aa）
链 I
1–395（395 aa）
链 J
1–395（395 aa）
链 K
1–395（395 aa）
链 L
1–395（395 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；3.7 W/V PEG 8000, 400 MM NACL 100 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 7.2
|
分辨率 4.20 Å |
| 1W8X Structural analysis of PRD1 提交 2004-10-01 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 900 PDB 声明：900-meric（900） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
链 B
1–395（395 aa）
链 C
1–395（395 aa）
链 D
1–395（395 aa）
链 E
1–395（395 aa）
链 F
1–395（395 aa）
链 G
1–395（395 aa）
链 H
1–395（395 aa）
链 I
1–395（395 aa）
链 J
1–395（395 aa）
链 K
1–395（395 aa）
链 L
1–395（395 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；3.7 W/V PEG 8000, 400 MM NACL 100 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 7.2
|
分辨率 4.20 Å |
| 7OOK Bacteriophage PRD1 Major Capsid Protein P3 in complex with CPZ 提交 2021-05-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
链 B
1–395（395 aa）
链 C
1–395（395 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 10 Z80 3-(2-chloro-10H-phenothiazin-10-yl)-N,N-dimethylpropan-1-amine × 3 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；please see: PMID: 10499799
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.216 |