当前蛋白身份：P22915
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BJA ACTIVATION DOMAIN OF THE PHAGE T4 TRANSCRIPTION FACTOR MOTA 提交 1998-06-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–96（95 aa）
片段：N-TERMINAL ACTIVATION DOMAIN
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 60% SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 8.0 - 9.0, pH 8.5
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.291 |
| 1BJA ACTIVATION DOMAIN OF THE PHAGE T4 TRANSCRIPTION FACTOR MOTA 提交 1998-06-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–96（95 aa）
片段：N-TERMINAL ACTIVATION DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 60% SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 8.0 - 9.0, pH 8.5
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.291 |
| 1I1S SOLUTION STRUCTURE OF THE TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION DOMAIN OF THE BACTERIOPHAGE T4 PROTEIN MOTA 提交 2001-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–96（96 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-96
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；301 K；离子强度（mmCIF原始值）200 mM potassium phosphate；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；301 K；离子强度（mmCIF原始值）200 mM potassium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
2mM MotNF U-15N | 200 mM potassium phosphate buffer, pH 6.5; 90% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
2mM MotNF U-13C,15N | 200 mM potassium phosphate buffer, pH 6.5; 90% H2O, 10% D2O
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分辨率未提供 |
| 1KAF DNA Binding Domain Of The Phage T4 Transcription Factor MotA (AA105-211) 提交 2001-11-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
105–211（107 aa）
片段：DNA binding domain residues 105-211
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；from 19% PEG 8000, 35 mM potassium phosphate pH 5.0, 3% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.258 |
| 1KAF DNA Binding Domain Of The Phage T4 Transcription Factor MotA (AA105-211) 提交 2001-11-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
105–211（107 aa）
片段：DNA binding domain residues 105-211
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；from 19% PEG 8000, 35 mM potassium phosphate pH 5.0, 3% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.258 |
| 1KAF DNA Binding Domain Of The Phage T4 Transcription Factor MotA (AA105-211) 提交 2001-11-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
105–211（107 aa）
片段：DNA binding domain residues 105-211
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；from 19% PEG 8000, 35 mM potassium phosphate pH 5.0, 3% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.258 |
| 1KAF DNA Binding Domain Of The Phage T4 Transcription Factor MotA (AA105-211) 提交 2001-11-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
105–211（107 aa）
片段：DNA binding domain residues 105-211
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；from 19% PEG 8000, 35 mM potassium phosphate pH 5.0, 3% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.258 |
| 1KAF DNA Binding Domain Of The Phage T4 Transcription Factor MotA (AA105-211) 提交 2001-11-01 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
105–211（107 aa）
片段：DNA binding domain residues 105-211
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；from 19% PEG 8000, 35 mM potassium phosphate pH 5.0, 3% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.258 |
| 1KAF DNA Binding Domain Of The Phage T4 Transcription Factor MotA (AA105-211) 提交 2001-11-01 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
105–211（107 aa）
片段：DNA binding domain residues 105-211
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；from 19% PEG 8000, 35 mM potassium phosphate pH 5.0, 3% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.258 |
| 5JLT The crystal structure of the bacteriophage T4 MotA C-terminal domain in complex with dsDNA reveals a novel protein-DNA recognition motif 提交 2016-04-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
93–211（119 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG 8K, 0.1 M Na Acetate, 0.1 M NaCacodylate, pH 6.5, and 3% glycerol
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.245 |
| 5JLT The crystal structure of the bacteriophage T4 MotA C-terminal domain in complex with dsDNA reveals a novel protein-DNA recognition motif 提交 2016-04-27 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
93–211（119 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG 8K, 0.1 M Na Acetate, 0.1 M NaCacodylate, pH 6.5, and 3% glycerol
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.245 |
| 5JLT The crystal structure of the bacteriophage T4 MotA C-terminal domain in complex with dsDNA reveals a novel protein-DNA recognition motif 提交 2016-04-27 | Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
93–211（119 aa）
链 D
93–211（119 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG 8K, 0.1 M Na Acetate, 0.1 M NaCacodylate, pH 6.5, and 3% glycerol
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.245 |
| 5JLT The crystal structure of the bacteriophage T4 MotA C-terminal domain in complex with dsDNA reveals a novel protein-DNA recognition motif 提交 2016-04-27 | Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
93–211（119 aa）
链 C
93–211（119 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG 8K, 0.1 M Na Acetate, 0.1 M NaCacodylate, pH 6.5, and 3% glycerol
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分辨率 2.96 Å R-free 0.245 |
| 6K4Y CryoEM structure of sigma appropriation complex 提交 2019-05-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–211（211 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.79 Å |