当前蛋白身份：P25098
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BAK SIGNAL TRANSDUCTION PLECKSTRIN HOMOLOGY DOMAIN OF G-PROTEIN COUPLED RECEPTOR KINASE 2 (BETA-ADRENERGIC RECEPTOR KINASE 1), C-TERMINAL EXTENDED, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
556–670（115 aa）
片段：C-TERMINAL EXTENDED PLECKSTRIN HOMOLOGY DOMAIN
|
突变：D552G, Y553S, A554H, L555M | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.5；308 K
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分辨率未提供 |
| 3CIK Human GRK2 in Complex with Gbetagamma subunits 提交 2008-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；277 K；200 mM NaCl, 5% ethylene glycol, 6.3% PEG 3350, pH 5.25, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.269 |
| 3KRW Human GRK2 in complex with Gbetgamma subunits and balanol (soak) 提交 2009-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–689（688 aa）
|
未记录 | BA1 BALANOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；Well contained 100 mM MES, pH 5.6, 200 mM NaCl, 9% PEG 3350. Drops were 1 uL protein, 1 uL well, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 3KRX Human GRK2 in complex with Gbetgamma subunits and balanol (co-crystal) 提交 2009-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–689（688 aa）
|
未记录 | BA1 BALANOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；Well contained 100 mM MES, pH 6.0, 200 mM NaCl, 9% PEG 3350. Drops were 1 uL protein, 1 uL well, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.270 |
| 3V5W Human G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Soluble Gbetagamma Subunits and Paroxetine 提交 2011-12-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
未记录 | 8PR Paroxetine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM MES pH 5.8, 200 mM NaCl, and 8% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.247 |
| 4MK0 Crystal structure of G protein-coupled receptor kinase 2 in complex with a a rationally designed paroxetine derivative 提交 2013-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–668（639 aa）
片段：unp residues 30-668
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 29X 5-{[(3S,4R)-4-(4-fluorophenyl)piperidin-3-yl]methoxy}-1H-isoindol-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；277 K；6% PEG 3350, 1M NaCl, 2 mM MgCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.238 |
| 4PNK G protein-coupled receptor kinase 2 in complex with GSK180736A 提交 2014-05-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
未记录 | KZQ (4S)-4-(4-fluorophenyl)-N-(2H-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MES, PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.259 |
| 5HE1 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG224062 提交 2016-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
29–670（642 aa）
片段：UNP residues 29-670
|
突变：S670A | ZS2 (4~{S})-4-[4-fluoranyl-3-(isoquinolin-1-ylmethylcarbamoyl)phenyl]-~{N}-(1~{H}-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-pyrimidine-5-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES, 0.8-1.2 M sodium chloride, 8-16% PEG3350
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.250 |
| 5UKK Human GRK2 in complex with human G-beta-gamma subunits and CCG211998 (14ak) 提交 2017-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–671（642 aa）
|
突变：S670A | MG MAGNESIUM ION × 1 8DJ 5-[(3S,4R)-3-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-2-fluoro-N-[(pyridin-2-yl)methyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES, 8-16% PEG3350, 0.8-1.2 M sodium chloride
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 5UKL Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG222886 (14bd) 提交 2017-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–671（642 aa）
|
突变：S670A | MG MAGNESIUM ION × 1 SIX 2-{5-[(3S,4R)-3-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-2-fluorophenyl}-N-[2-(1H-pyrazol-4-yl)ethyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES, 0.8-1.2 M sodium chloride, 8-16% PEG3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.228 |
| 5UUU Design, Synthesis, and Evaluation of the First Selective and Potent G-protein-Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) Inhibitor for the Potential Treatment of Heart Failure 提交 2017-02-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–538（516 aa）
片段：UNP residues 23-538
|
未记录 | QRW 3-({[4-methyl-5-(pyridin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)-N-[2-(trifluoromethyl)benzyl]benzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；273 K；18% PEG MME 2000, 0.1 M MES pH 5.6, and 0.0175M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.257 |
| 5UVC Design, Synthesis, and Evaluation of the First Selective and Potent G-protein-Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) Inhibitor for the Potential Treatment of Heart Failure 提交 2017-02-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–538（516 aa）
片段：UNP residues 23-538
|
未记录 | 8PV N-benzyl-3-({[5-(pyridin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)benzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；273 K；18% PEG MME 2000, 100mM MES pH 5.9, 17.5mM Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.260 |
| 5WG3 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG258748 提交 2017-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
未记录 | AFM 2-fluoro-5-[(3S,4R)-3-{[(1H-indazol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-N-[(1H-pyrazol-3-yl)methyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 1.1 M NaCl, 8% PEG3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 5WG4 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG257284 提交 2017-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
未记录 | AFV 2-fluoro-5-[(3S,4R)-3-{[(1H-indazol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-N-[(pyridin-2-yl)methyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 6% PEG 3350, 1 M NaCl
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.279 |
| 5WG5 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG224061 提交 2017-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
未记录 | ZSO 5-{[(3S,4R)-4-(4-fluorophenyl)piperidin-3-yl]methoxy}-2H-indazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 8-15% PEG3350, 0.8-1.2 M NaCl
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.232 |
| 6C2Y Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG257142 提交 2018-01-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
突变：S670A | EJS (4R,5R,6S)-4-[4-fluoro-3-({[3-(methoxymethyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]methyl}carbamoyl)phenyl]-N-(2H-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxohexahydropyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 800 mM NaCl, 8% PEG 3350
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.292 |
| 6U7C Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG258747 提交 2019-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
突变：C68S | Q1Y 5-[(3S,4R)-3-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-2-fluoro-N-[(2H-indazol-3-yl)methyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 1.1 M NaCl, 6% PEG 3350
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.262 |
| 7K7L Structure of a hit for G Protein Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) Inhibitor for the Potential Treatment of Heart Failure 提交 2020-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–668（639 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 W4D 3-benzyl-6-(1H-pyrazol-4-yl)quinazolin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；2% PEG 3350, 0.1M MES pH 6.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.244 |
| 7K7Z Structure of a hit for G Protein Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) Inhibitor for the Potential Treatment of Heart Failure 提交 2020-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–668（639 aa）
|
未记录 | W4G 3-benzyl-7-(1H-pyrazol-4-yl)quinazolin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；2% PEG 3350, 0.1M MES pH 6.5, 0.2M NaCl
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分辨率 2.61 Å R-free 0.262 |
| 7PWD Structure of an inhibited GRK2-G-beta and G-gamma complex 提交 2021-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
片段：NONE
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突变：S670A | 8DS 4-chloranyl-N-[2-(4-chlorophenyl)ethyl]thieno[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；ethylene glycol, PEG 3350, MES, NaCl
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分辨率 2.60 Å R-free 0.230 |