当前蛋白身份:P25445 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1DDF FAS DEATH DOMAIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-11-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 218–335(118 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4
分辨率未提供
2NA7 Transmembrane domain of human Fas/CD95 death receptor 提交 2015-12-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 171–198(28 aa) 片段:Helical transmembrane residues 171-198
链 B 171–198(28 aa) 片段:Helical transmembrane residues 171-198
链 C 171–198(28 aa) 片段:Helical transmembrane residues 171-198
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Human Fas Transmembrane Domain, 60 mM [U-100% 2H] acyl chains DMPC, 120 mM [U-100% 2H] acyl chains DHPC, 20 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-85% 2H] Human Fas Transmembrane Domain, 60 mM DMPC, 120 mM DHPC, 20 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N; U-100% 2H] Human Fas Transmembrane Domain, 0.5 mM [U-15% 13C] Human Fas Transmembrane Domain, 60 mM [U-100% 2H] acyl chains DMPC, 120 mM [U-100% 2H] acyl chains DHPC, 20 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
3EWT Crystal Structure of calmodulin complexed with a peptide 提交 2008-10-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 230–254(25 aa) 片段:Helix(1+2) of death domain
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 5.5;293 K;25%(w/v) PEG8000, 0.2M Sodium Acetate, 0.1M Sodium cacodylate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
链 C 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
链 G 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 I 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
链 K 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 M 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
链 O 223–335(113 aa) 片段:Fas DD, UNP residues 223-335
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3THM Crystal structure of Fas receptor extracellular domain in complex with Fab EP6b_B01 提交 2011-08-19 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 17–172(156 aa) 片段:extracellular domain
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;20% PEG4000, 10% isopropanol, 100 mM HEPES/NaOH, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.221
3TJE Crystal structure of Fas receptor extracellular domain in complex with Fab E09 提交 2011-08-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 17–172(156 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 1 CD CADMIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;277 K;20% PEG4000, 5 mM CdCl2, 100 mM Tris/HOAc, pH 8.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 1.93 Å R-free 0.232
9NCQ Cryo-EM structure of Fas-FADD complex 提交 2025-02-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 225–320(96 aa)
链 B 225–320(96 aa)
链 C 225–320(96 aa)
链 D 225–320(96 aa)
链 E 225–320(96 aa)
链 F 225–320(96 aa)
链 G 225–320(96 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å