当前蛋白身份：P25685
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1HDJ HUMAN HSP40 (HDJ-1), NMR 提交 1996-05-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–76（76 aa）
片段：J-DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.8；303 K
|
分辨率未提供 |
| 2QLD human Hsp40 Hdj1 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
158–340（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100mM Citric buffer, PEG400 25%, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.336 |
| 3AGX Crystal structure of human Hsp40 Hdj1 peptide-binding domain 提交 2010-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
161–340（180 aa）
片段：UNP residues 161-340
链 B
161–340（180 aa）
片段：UNP residues 161-340
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；13% PEG 3350, 0.1M Na citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.247 |
| 3AGY Crystal structure of human Hsp40 Hdj1 peptide-binding domain complexed with a C-terminal peptide of Hsp70 提交 2010-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
161–340（180 aa）
片段：UNP residues 161-340
链 B
161–340（180 aa）
片段：UNP residues 161-340
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；18% PEG 3350, 0.1M Na citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.247 |
| 3AGZ Crystal structure of human Hsp40 Hdj1 peptide-binding domain complexed with a C-terminal peptide of Hsp70 提交 2010-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
151–340（190 aa）
片段：UNP residues 151-340
链 B
151–340（190 aa）
片段：UNP residues 151-340
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；277 K；18% PEG 3350, 0.1M CHES, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.269 |
| 4WB7 Crystal structure of a chimeric fusion of human DnaJ (Hsp40) and cAMP-dependent protein kinase A (catalytic alpha subunit) 提交 2014-09-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
片段：UNP P25685 residues 2-70,UNP P17612 residues 16-351
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；70mM sodium cacodylate pH 6.5, 150mM magnesium acetate, 20mM zinc chloride, 5% glycerol, 11.5% PEG 8000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.188 |
| 4WB7 Crystal structure of a chimeric fusion of human DnaJ (Hsp40) and cAMP-dependent protein kinase A (catalytic alpha subunit) 提交 2014-09-02 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–70（69 aa）
片段：UNP P25685 residues 2-70,UNP P17612 residues 16-351
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；70mM sodium cacodylate pH 6.5, 150mM magnesium acetate, 20mM zinc chloride, 5% glycerol, 11.5% PEG 8000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.188 |
| 6BYR Structures of the PKA RI alpha holoenzyme with the FLHCC driver J-PKAc alpha or native PKAc alpha 提交 2017-12-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
链 C
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM NaCl, 16-18% pentaerythritol propoxylate and 10% dimethyl sulfoxide
|
分辨率 3.66 Å R-free 0.249 |
| 6BYR Structures of the PKA RI alpha holoenzyme with the FLHCC driver J-PKAc alpha or native PKAc alpha 提交 2017-12-21 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM NaCl, 16-18% pentaerythritol propoxylate and 10% dimethyl sulfoxide
|
分辨率 3.66 Å R-free 0.249 |
| 6BYR Structures of the PKA RI alpha holoenzyme with the FLHCC driver J-PKAc alpha or native PKAc alpha 提交 2017-12-21 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM NaCl, 16-18% pentaerythritol propoxylate and 10% dimethyl sulfoxide
|
分辨率 3.66 Å R-free 0.249 |
| 6WJF PKA RIIbeta holoenzyme with DnaJB1-PKAc fusion in fibrolamellar hepatoceullar carcinoma 提交 2020-04-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
链 B
2–70（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 6WJG PKA RIIbeta holoenzyme with DnaJB1-PKAc fusion in fibrolamellar hepatoceullar carcinoma 提交 2020-04-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
链 B
2–70（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.20 Å |
| 6Z5N DnaJB1 JD-GF 提交 2020-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–110（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成
4.0 mM [U-13C; U-15N] DnaJB1 JD-GF, 2.0 mM [U-15N] DnaJB1 JD-GF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-15N] DnaJB1 JD-GF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2.5 mM [U-13C; U-15N] DnaJB1 JD-GF, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
4.0 mM [U-13C; U-15N] DnaJB1 JD-GF, 2.0 mM [U-15N] DnaJB1 JD-GF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7NDX Crystal structure of the human HSP40 DNAJB1-CTDs in complex with a peptide of NudC 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
157–340（184 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；298 K；0.1 M of sodium acetate trihydrate and 15% (v/v) of polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.268 |
| 8FE2 Structure of J-PKAc chimera complexed with Aplithianine A 提交 2022-12-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XTI 6-[(6M)-6-(1-methyl-1H-imidazol-5-yl)-2,3-dihydro-4H-1,4-thiazin-4-yl]-9H-purine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；200 mM Lithium sulfate, 100 mM HEPES 7.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.251 |
| 8FE2 Structure of J-PKAc chimera complexed with Aplithianine A 提交 2022-12-05 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XTI 6-[(6M)-6-(1-methyl-1H-imidazol-5-yl)-2,3-dihydro-4H-1,4-thiazin-4-yl]-9H-purine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；200 mM Lithium sulfate, 100 mM HEPES 7.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.251 |
| 8FE5 Structure of J-PKAc chimera complexed with Aplithianine B 提交 2022-12-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XTT 6-[(6P)-6-(1-methyl-1H-imidazol-5-yl)-2,3-dihydro-4H-1,4-thiazin-4-yl]-7,9-dihydro-8H-purin-8-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；200 mM Lithium Sulfate, 100 mM HEPES 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.243 |
| 8FE5 Structure of J-PKAc chimera complexed with Aplithianine B 提交 2022-12-05 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XTT 6-[(6P)-6-(1-methyl-1H-imidazol-5-yl)-2,3-dihydro-4H-1,4-thiazin-4-yl]-7,9-dihydro-8H-purin-8-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；200 mM Lithium Sulfate, 100 mM HEPES 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.243 |
| 8FEC Structure of J-PKAc chimera complexed with Aplithianine derivative 提交 2022-12-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XU0 6-[(6P)-6-(4-bromo-1-methyl-1H-imidazol-5-yl)-2,3-dihydro-4H-1,4-thiazin-4-yl]-7H-purine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；200 mM Lithium sulfate, 100 mM HEPES 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.287 |
| 8FEC Structure of J-PKAc chimera complexed with Aplithianine derivative 提交 2022-12-06 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XU0 6-[(6P)-6-(4-bromo-1-methyl-1H-imidazol-5-yl)-2,3-dihydro-4H-1,4-thiazin-4-yl]-7H-purine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；200 mM Lithium sulfate, 100 mM HEPES 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.287 |
| 9NFS Structure of J-PKAc chimera in complex with Aplithianine j1 提交 2025-02-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BX1 (4P)-4-[4-(pyrimidin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1,4-thiazin-6-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277.15 K；0.2 M LiCl, 0.1 M hopes, pH 7.6, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.334 |
| 9NFS Structure of J-PKAc chimera in complex with Aplithianine j1 提交 2025-02-21 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–70（69 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BX1 (4P)-4-[4-(pyrimidin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1,4-thiazin-6-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277.15 K；0.2 M LiCl, 0.1 M hopes, pH 7.6, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.334 |