当前蛋白身份:P25714
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3BLC Crystal structure of the periplasmic domain of the Escherichia Coli YIDC 提交 2007-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
26–340(315 aa)
片段:UNP residues 26-340
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突变:E228A, K229A, E231A, K232A, K234A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.1;295 K;0.1 M glycine, 0.2 M ammonium sulfate, 13% PEG3350, pH 3.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 3BLC Crystal structure of the periplasmic domain of the Escherichia Coli YIDC 提交 2007-12-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
26–340(315 aa)
片段:UNP residues 26-340
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突变:E228A, K229A, E231A, K232A, K234A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.1;295 K;0.1 M glycine, 0.2 M ammonium sulfate, 13% PEG3350, pH 3.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 3BLC Crystal structure of the periplasmic domain of the Escherichia Coli YIDC 提交 2007-12-10 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
26–340(315 aa)
片段:UNP residues 26-340
链 B
26–340(315 aa)
片段:UNP residues 26-340
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突变:E228A, K229A, E231A, K232A, K234A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:E228A, K229A, E231A, K232A, K234A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.1;295 K;0.1 M glycine, 0.2 M ammonium sulfate, 13% PEG3350, pH 3.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 3BS6 1.8 Angstrom crystal structure of the periplasmic domain of the membrane insertase YidC 提交 2007-12-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
56–329(274 aa)
片段:UNP residues 56-329
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 5 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;21% PEG3350, 0.2M calcium acetate, 10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, pH7.5, temperature 293K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 3BS6 1.8 Angstrom crystal structure of the periplasmic domain of the membrane insertase YidC 提交 2007-12-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
56–329(274 aa)
片段:UNP residues 56-329
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;21% PEG3350, 0.2M calcium acetate, 10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, pH7.5, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 3BS6 1.8 Angstrom crystal structure of the periplasmic domain of the membrane insertase YidC 提交 2007-12-22 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
56–329(274 aa)
片段:UNP residues 56-329
链 B
56–329(274 aa)
片段:UNP residues 56-329
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 10 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;21% PEG3350, 0.2M calcium acetate, 10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, pH7.5, temperature 293K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 4UTQ A structural model of the active ribosome-bound membrane protein insertase YidC 提交 2014-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–548(548 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,
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分辨率 8.00 Å |
| 5MG3 EM fitted model of bacterial holo-translocon 提交 2016-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
2–548(547 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 14.00 Å |
| 9RBF Structure of a stalled E. coli 70S RNC-NuoK-86 in complex with the membrane protein insertase SecYEG-YidC 提交 2025-05-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:61-meric(61) 与全部聚合物一致 |
链 9
1–548(548 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.44 Å |