当前蛋白身份：P26349
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JRJ Solution structure of exendin-4 in 30-vol% trifluoroethanol 提交 2001-08-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–39（39 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.9；280 K；离子强度（mmCIF原始值）15mM potassium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
Natural abundance | 2mg/ml in pH 5.9 15mM phosphate buffer with 30 vol-% trifluoroethanol added
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分辨率未提供 |
| 3C59 Crystal structure of the ligand-bound glucagon-like peptide-1 receptor extracellular domain 提交 2008-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
56–86（31 aa）
片段：UNP residues 56-86
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.1M MgCl2, 0.4M MgTartrate, 9mM n-Decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.241 |
| 3C5T Crystal structure of the ligand-bound glucagon-like peptide-1 receptor extracellular domain 提交 2008-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
56–86（31 aa）
片段：UNP residues 56-86
|
未记录 | 10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.1M MgCl2, 0.4M MgTartrate, 9mM n-Decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 5OTT Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with exendin-4 variant Gly2Hcs/Thr5Hcs 提交 2017-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
48–86（39 aa）
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突变：G2HCS, T5HCS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Imidazole pH 6.5, 1.0 M Sodium acetate trihydrate
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分辨率 1.92 Å R-free 0.209 |
| 6GDZ exendin-4 based dual GLP-1/glucagon receptor agonist 提交 2018-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
48–86（39 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EVT (2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）35mM sodium phosphate；压力 1
NMR样品组成
5 mg/mL Peptide 5, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
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分辨率未提供 |
| 6GE2 exendin-4 based dual GLP-1/glucagon receptor agonist 提交 2018-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
48–86（39 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EVT (2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）35mM sodium phosphate；压力 1
NMR样品组成
5 mg/mL Peptide 12, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
|
分辨率未提供 |
| 7LLL Exendin-4-bound Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1) Receptor in complex with Gs protein 提交 2021-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
48–86（39 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 7MLL Solution structure of Exenatide (exendin-4) in 30-vol% trifluoroethanol using CS-Rosetta 提交 2021-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
48–86（39 aa）
片段：UNP Residue 48-86
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.35；315 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
13 mM 'NA-' Exenatide (exendin-4), 20 mM 'NA-' sodium phosphate, 30 % v/v [U-99% 2H] TFE, 10 % v/v [U-99% 2H] D2O, 0.01 mg/mL 'NA-' DSS, 60 % H2O/30%Trifluoroethanol/10 % D2O | 60 % H2O/30%Trifluoroethanol/10 % D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G0M Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 288K 提交 2024-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；288 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.8 mM polypeptide, 1 % sodium-azide, 1 % DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G0N Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 299K 提交 2024-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；299 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.8 mM non-labelled polypeptide, 1 % non-labelled sodium-azide, 1 % non-labelled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 9G20 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 310K 提交 2024-07-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.8 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G21 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 321K 提交 2024-07-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；321 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.8 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G22 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bDR) at 277K 提交 2024-07-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；277 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G2N Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera ( Ex-4-Tc5bDR) at 288K 提交 2024-07-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；288 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G2O Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex-4-Tc5bDR) at 299K 提交 2024-07-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；299 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G31 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex-4-Tc5bDR) at 310K 提交 2024-07-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；310 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9G32 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex-4-Tc5bDR) at 321K 提交 2024-07-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1；321 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.85 mM non-labeld polypeptide, 1 mM non-labeld sodium azide, 1 % non-labeld DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 9G5P Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 277K 提交 2024-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–86（25 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；277 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1
NMR样品组成
0.8 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |