当前蛋白身份：P26747
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2M5S High-resolution NMR structure and cryo-EM imaging support multiple functional roles for the accessory I-domain of phage P22 coat protein 提交 2013-03-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
223–345（123 aa）
片段：;This domain has previously been called the 'extra-density domain' and 'telokin-like domain' in the literature based on cryo-EM models
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 20 mM sodium phosphate, 1% H2O/99% D2O | 1% H2O/99% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3IYH P22 procapsid coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 360 PDB 声明：360-MERIC（360） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
blot 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 3IYH P22 procapsid coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
blot 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 3IYH P22 procapsid coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
blot 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 3IYH P22 procapsid coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
blot 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 3IYH P22 procapsid coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
blot 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 3IYI P22 expanded head coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 420 PDB 声明：420-meric（420） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.10 Å |
| 3IYI P22 expanded head coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.10 Å |
| 3IYI P22 expanded head coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric（35） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.10 Å |
| 3IYI P22 expanded head coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.10 Å |
| 3IYI P22 expanded head coat protein structures reveal a novel mechanism for capsid maturation: Stability without auxiliary proteins or chemical cross-links 提交 2009-12-14 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6；pH 7.6；20 mM sodium phosphate buffer, pH = 7.6
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 2-3 seconds before plunging；89 K；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.10 Å |
| 5UU5 Bacteriophage P22 mature virion capsid protein 提交 2017-02-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 420 PDB 声明：420-meric（420） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.6, 1 mM MgCl2, 25 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；single blot, one second duration
|
分辨率 3.30 Å |
| 5UU5 Bacteriophage P22 mature virion capsid protein 提交 2017-02-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.6, 1 mM MgCl2, 25 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；single blot, one second duration
|
分辨率 3.30 Å |
| 5UU5 Bacteriophage P22 mature virion capsid protein 提交 2017-02-16 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric（35） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.6, 1 mM MgCl2, 25 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；single blot, one second duration
|
分辨率 3.30 Å |
| 5UU5 Bacteriophage P22 mature virion capsid protein 提交 2017-02-16 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.6, 1 mM MgCl2, 25 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；single blot, one second duration
|
分辨率 3.30 Å |
| 5UU5 Bacteriophage P22 mature virion capsid protein 提交 2017-02-16 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；50 mM Tris, pH 7.6, 1 mM MgCl2, 25 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；single blot, one second duration
|
分辨率 3.30 Å |
| 8GN5 Designed pH-responsive P22 VLP 提交 2022-08-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4–428（425 aa）
链 B
4–428（425 aa）
链 C
4–428（425 aa）
链 D
4–428（425 aa）
|
突变：S43H, E54H, E153H, N287H 突变：S43H, E54H, E153H, N287H 突变：S43H, E54H, E153H, N287H 突变：S43H, E54H, E153H, N287H | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；PBS buffer pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.02 Å |
| 8I1T The asymmetric unit of P22 empty capsid 提交 2023-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8I1V The asymmetric unit of P22 procapsid 提交 2023-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8U10 In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1:gp4:gp5:gp10:gp9 N-term complex in conformation 1 at 3.2A resolution 提交 2023-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric（58） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
链 H
1–430（430 aa）
链 I
1–430（430 aa）
链 J
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8U11 In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1:gp5:gp4: gp10: gp9 N-term complex in conformation 2 at 3.1A resolution 提交 2023-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric（58） 与蛋白数一致 |
链 A
1–430（430 aa）
链 B
1–430（430 aa）
链 C
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
链 E
1–430（430 aa）
链 F
1–430（430 aa）
链 G
1–430（430 aa）
链 H
1–430（430 aa）
链 I
1–430（430 aa）
链 J
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9PGG Cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1-gp5-gp4 complex at 2.76 angstrom 提交 2025-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：39-meric（39） 与蛋白数一致 |
链 Aa
1–430（430 aa）
链 Ab
1–430（430 aa）
链 Ac
1–430（430 aa）
链 Ad
1–430（430 aa）
链 Ae
1–430（430 aa）
链 Af
1–430（430 aa）
链 Ag
1–430（430 aa）
链 Ah
1–430（430 aa）
链 Ai
1–430（430 aa）
链 Aj
1–430（430 aa）
链 Ak
1–430（430 aa）
链 Al
1–430（430 aa）
链 Am
1–430（430 aa）
链 An
1–430（430 aa）
链 Ao
1–430（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |