当前蛋白身份：P27692
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2EXU Crystal Structure of Saccharomyces cerevisiae transcription elongation factors Spt4-Spt5NGN domain 提交 2005-11-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
285–375（91 aa）
片段：Spt4, Spt5 NGN domain
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 EOH ETHANOL × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；30% EtOH, 50mM NaCl, 100mM Tris-HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.221 |
| 4YTK Structure of the KOW1-Linker1 domain of Transcription Elongation Factor Spt5 提交 2015-03-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
382–511（130 aa）
片段：UNP Residues 382-511
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 30% (w/v) PEG 3350
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分辨率 1.09 Å R-free 0.199 |
| 4YTL Structure of the KOW2-KOW3 Domain of Transcription Elongation Factor Spt5. 提交 2015-03-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
534–632（99 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.0), 0.5 M ammonium sulfate, and 1.0 M lithium sulfate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 4YTL Structure of the KOW2-KOW3 Domain of Transcription Elongation Factor Spt5. 提交 2015-03-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
534–632（99 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.0), 0.5 M ammonium sulfate, and 1.0 M lithium sulfate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–1063（1063 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |
| 8JCH Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 1 (Pol II Rat1-PTTC1) 提交 2023-05-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 W
1–1063（1063 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8K5P Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 2 (Pol II Rat1-PTTC2) 提交 2023-07-23 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 W
1–1063（1063 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8RAM Structure of Sen1 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric（19） 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–1063（1063 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8RAP Structure of Sen1-ADP.BeF3 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric（19） 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–1063（1063 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.30 Å |