当前蛋白身份：P28289
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4PKG Complex of ATP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
50–101（52 aa）
片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
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分辨率 1.80 Å R-free 0.187 |
| 4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
50–101（52 aa）
片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
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分辨率 2.15 Å R-free 0.326 |
| 4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
50–101（52 aa）
片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
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分辨率 2.15 Å R-free 0.326 |
| 4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
50–101（52 aa）
片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
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分辨率 2.15 Å R-free 0.326 |
| 4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 | Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
50–101（52 aa）
片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
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分辨率 2.15 Å R-free 0.326 |
| 4PKI Complex of ATP-actin With the C-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
160–349（190 aa）
片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 2 (UNP residues 160-349)
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.25 M sodium chloride, 12% w/v PEG3350
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分辨率 2.30 Å R-free 0.201 |
| 4Z8G Chimera of Tropomodulin-1 and Leiomodin-1 Actin-Binding Site 2 (TL1 ABS2) 提交 2015-04-08 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
163–228（66 aa）
片段：Tropomodulin-1 residues 163-228 (UNP), Leiomodin-1 Actin-Binding Site 2 (UNP residues 364-486)
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.5 K；35% MPD, 0.1 M MES/NaOH, pH 6.0, 200 mM lithium sulfate
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分辨率 2.10 Å R-free 0.254 |
| 4Z94 Actin Complex With a Chimera of Tropomodulin-1 and Leiomodin-1 Actin-Binding Site 2 提交 2015-04-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
160–228（69 aa）
片段：;Gelsolin residues 12-136 (UNP), linker,Tropomodulin-1 residues 160-228 (UNP), Leiomodin-1 Actin-Binding Site 2 (UNP residues 364-486)
;
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291.5 K；20% PEG3350, 200 mM lithium sulfate, 100 mM Tris, pH 8.8, 15% glycerol
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分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 8F8T Cryo-EM structure of the Tropomodulin-capped pointed end of F-actin 提交 2022-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 T
1–359（359 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 0
Blot time 2.5 s
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分辨率 3.26 Å |