当前蛋白身份:P28715
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5EKF Crystallization and X-ray Diffraction Data Collection of Importin-alpha from Mus musculus Complexed with a XPG NLS Peptide, fragment 1 提交 2015-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1054–1077(24 aa)
片段:UNP residues 1054-1077
链 C
1054–1077(24 aa)
片段:UNP residues 1054-1077
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.6-0.7 M sodium citrate, 10 mM DTT
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.192 |
| 6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–112(111 aa)
链 AAA
750–990(241 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 BBB
2–112(111 aa)
链 BBB
750–990(241 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 CCC
2–112(111 aa)
链 CCC
750–990(241 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 DDD
2–112(111 aa)
链 DDD
750–990(241 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 6TUS human XPG, Apo2 form 提交 2020-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–112(112 aa)
链 A
750–990(241 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Bis-Tris pH 6.5, 200 mM Amm. Sulfate.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 6TUS human XPG, Apo2 form 提交 2020-01-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–112(112 aa)
链 B
750–990(241 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Bis-Tris pH 6.5, 200 mM Amm. Sulfate.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 6TUW human XPG-DNA, Complex 1 提交 2020-01-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–112(112 aa)
链 A
750–990(241 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 4.0
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.293 |
| 6TUX human XPG-DNA, Complex 2 提交 2020-01-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–112(112 aa)
链 A
750–986(237 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 4.0
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.303 |
| 6TUX human XPG-DNA, Complex 2 提交 2020-01-08 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 B
1–112(112 aa)
链 B
750–986(237 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 4.0
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.303 |
| 6VBH Human XPG endonuclease catalytic domain 提交 2019-12-18 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
2–85(84 aa)
链 A
766–987(222 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 40% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2,100 mM MgCl2
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 wit 24% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, 250 mM MgCl2, 0.5 mM SmSO4, 10 mM DTT
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 32% AmSO4, 10 mM DTT, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, and 50 mM MgCl2
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 6VBH Human XPG endonuclease catalytic domain 提交 2019-12-18 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
2–85(84 aa)
链 A
766–987(222 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 30 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 40% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2,100 mM MgCl2
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 wit 24% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, 250 mM MgCl2, 0.5 mM SmSO4, 10 mM DTT
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 32% AmSO4, 10 mM DTT, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, and 50 mM MgCl2
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致 |
链 S
1–1186(1186 aa)
|
突变:D812N | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致 |
链 S
1–1186(1186 aa)
|
突变:D812N | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物一致 |
链 S
1–1186(1186 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |