当前蛋白身份:P28715 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5EKF Crystallization and X-ray Diffraction Data Collection of Importin-alpha from Mus musculus Complexed with a XPG NLS Peptide, fragment 1 提交 2015-11-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1054–1077(24 aa) 片段:UNP residues 1054-1077
链 C 1054–1077(24 aa) 片段:UNP residues 1054-1077
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.6-0.7 M sodium citrate, 10 mM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.192
6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 AAA 2–112(111 aa)
链 AAA 750–990(241 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 BBB 2–112(111 aa)
链 BBB 750–990(241 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 CCC 2–112(111 aa)
链 CCC 750–990(241 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
6TUR human XPG, Apo1 form 提交 2020-01-08 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 DDD 2–112(111 aa)
链 DDD 750–990(241 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Citric acid pH 3.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
6TUS human XPG, Apo2 form 提交 2020-01-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–112(112 aa)
链 A 750–990(241 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Bis-Tris pH 6.5, 200 mM Amm. Sulfate.
分辨率 2.50 Å R-free 0.237
6TUS human XPG, Apo2 form 提交 2020-01-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–112(112 aa)
链 B 750–990(241 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;25% PEG 3350, 100 mM Bis-Tris pH 6.5, 200 mM Amm. Sulfate.
分辨率 2.50 Å R-free 0.237
6TUW human XPG-DNA, Complex 1 提交 2020-01-08 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–112(112 aa)
链 A 750–990(241 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 4.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.293
6TUX human XPG-DNA, Complex 2 提交 2020-01-08 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–112(112 aa)
链 A 750–986(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 4.0
分辨率 3.10 Å R-free 0.303
6TUX human XPG-DNA, Complex 2 提交 2020-01-08 Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 B 1–112(112 aa)
链 B 750–986(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;5% PEG 3350, 50 mM Na Citrate pH 4.0
分辨率 3.10 Å R-free 0.303
6VBH Human XPG endonuclease catalytic domain 提交 2019-12-18 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–85(84 aa)
链 A 766–987(222 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 40% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2,100 mM MgCl2
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 wit 24% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, 250 mM MgCl2, 0.5 mM SmSO4, 10 mM DTT
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 32% AmSO4, 10 mM DTT, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, and 50 mM MgCl2
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
6VBH Human XPG endonuclease catalytic domain 提交 2019-12-18 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–85(84 aa)
链 A 766–987(222 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 30 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 40% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2,100 mM MgCl2
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 wit 24% AmSO4, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, 250 mM MgCl2, 0.5 mM SmSO4, 10 mM DTT
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;Mixed 1:1 with 32% AmSO4, 10 mM DTT, 200 mM Imidizole/Malate Buffer pH 4.2, and 50 mM MgCl2
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致
链 S 1–1186(1186 aa)
突变:D812N SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 S 1–1186(1186 aa)
突变:D812N SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物一致
链 S 1–1186(1186 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å