当前蛋白身份:P28905 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1EM8 Crystal structure of chi and psi subunit heterodimer from DNA POL III 提交 2000-03-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–147(147 aa) 片段:RESIDUES 1-147
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;277 K;methylpentanediol, HEPES, PEG 4000, Glycerol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.265
1EM8 Crystal structure of chi and psi subunit heterodimer from DNA POL III 提交 2000-03-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–147(147 aa) 片段:RESIDUES 1-147
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;277 K;methylpentanediol, HEPES, PEG 4000, Glycerol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.265
3SXU Structure of the E. coli SSB-DNA polymerase III interface 提交 2011-07-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–147(147 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;298 K;25% PEG 4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.208
9OYH Structure of the E. coli clamp loader DnaX-complex loading beta-clamp onto 10-nt gapped DNA in state 1 the DNA recognition state 提交 2025-06-04 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物一致
链 L 2–147(146 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.54 Å