当前蛋白身份：P29056
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1NGM Crystal structure of a yeast Brf1-TBP-DNA ternary complex 提交 2002-12-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
437–506（70 aa）
片段：Homology domain II
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES, NaCl, BME, glycerol, MgCl2, PEG2000MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.308 |
| 1NGM Crystal structure of a yeast Brf1-TBP-DNA ternary complex 提交 2002-12-17 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
437–506（70 aa）
片段：Homology domain II
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES, NaCl, BME, glycerol, MgCl2, PEG2000MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.308 |
| 1NGM Crystal structure of a yeast Brf1-TBP-DNA ternary complex 提交 2002-12-17 | Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 J
437–506（70 aa）
片段：Homology domain II
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES, NaCl, BME, glycerol, MgCl2, PEG2000MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.308 |
| 1NGM Crystal structure of a yeast Brf1-TBP-DNA ternary complex 提交 2002-12-17 | Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 N
437–506（70 aa）
片段：Homology domain II
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES, NaCl, BME, glycerol, MgCl2, PEG2000MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.308 |
| 6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–382（382 aa）
链 R
438–596（159 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–382（382 aa）
链 R
438–596（159 aa）
|
突变：C438S 突变：C438S | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–382（382 aa）
链 R
438–596（159 aa）
|
突变：C438S 突变：C438S | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–382（382 aa）
链 R
438–596（159 aa）
|
突变：C438S 突变：C438S | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–596（596 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–596（596 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–596（596 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–596（596 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–596（596 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7Q5B Cryo-EM structure of Ty3 retrotransposon targeting a TFIIIB-bound tRNA gene 提交 2021-11-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–596（596 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 8FFZ TFIIIA-TFIIIC-Brf1-TBP complex bound to 5S rRNA gene 提交 2022-12-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 H
1–382（382 aa）
链 H
439–596（158 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |