当前蛋白身份：P31431
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EJP SOLUTION STRUCTURE OF THE SYNDECAN-4 WHOLE CYTOPLASMIC DOMAIN 提交 2000-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
171–198（28 aa）
片段：WHOLE CYTOPLASMIC DOMAIN
链 B
171–198（28 aa）
片段：WHOLE CYTOPLASMIC DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 1
NMR样品组成
2-4mM Syndecan-4 peptide ; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-4mM Syndecan-4 peptide ; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-4mM Syndecan-4 peptide ; 50mM phosphate buffer; 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1EJQ SOLUTION STRUCTURE OF THE SYNDECAN-4 WHOLE CYTOPLASMIC DOMAIN IN THE PRESENCE OF PHOSPHATIDYLINOSITOL 4,5-BISPHOSPHATE 提交 2000-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
171–198（28 aa）
片段：WHOLE CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 171-198)
链 B
171–198（28 aa）
片段：WHOLE CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 171-198)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate；压力 1
NMR样品组成
2-4mM Syndecan-4 cytoplasmic domain;Molar ratio of 4:1(syndecan-4 peptide:PIP2);50mM sodium phosphate;90% H2O 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-4mM Syndecan-4 cytoplasmic domain;Molar ratio of 4:1(syndecan-4 peptide:PIP2);50mM sodium phosphate;90% H2O 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-4mM Syndecan-4 cytoplasmic domain;Molar ratio of 4:1(syndecan-4 peptide:PIP2);50mM sodium phosphate;90% H2O 10% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 1OBY Crystal structure of the complex of PDZ2 of syntenin with a syndecan-4 peptide. 提交 2003-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
193–198（6 aa）
片段：LAST 6 RESIDUES, RESIDUES 193-198
链 Q
193–198（6 aa）
片段：LAST 6 RESIDUES, RESIDUES 193-198
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；SITTING DROP WITH 0.1 M HEPES, PH 6.8, 1.6 M AMMONIUM SULFATE, 20 MM COCL2, AND 0.2 MGSO4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.226 |
| 1YBO Crystal structure of the PDZ tandem of human syntenin with syndecan peptide 提交 2004-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
182–198（17 aa）
链 D
182–198（17 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；20% PEG 3350, 0.2M NH4Cl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
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分辨率 2.30 Å R-free 0.273 |
| 8BLV The PDZ domains of human SDCBP with a bound SDC4 C-terminal peptide 提交 2022-11-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
191–198（8 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；200 mM sodium sulphate, 100 mM bis-tris-propane, 10% ethylene glycol, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.222 |
| 8BLV The PDZ domains of human SDCBP with a bound SDC4 C-terminal peptide 提交 2022-11-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
191–198（8 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；200 mM sodium sulphate, 100 mM bis-tris-propane, 10% ethylene glycol, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.222 |