当前蛋白身份：P32591
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2FQ3 Structure and function of the SWIRM domain, a conserved protein module found in chromatin regulatory complexes 提交 2006-01-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
309–398（90 aa）
片段：SWIRM domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris HCl (pH 8.5), 10% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.40 Å R-free 0.213 |
| 6L9J Structure of yeast Snf5 and Swi3 subcomplex 提交 2019-11-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
212–398（187 aa）
链 C
212–398（187 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM HEPES (pH 7.8), 230mM Li2SO4, 20%-24% (w/v) PEG 3350
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分辨率 2.64 Å R-free 0.280 |
| 6L9J Structure of yeast Snf5 and Swi3 subcomplex 提交 2019-11-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
212–398（187 aa）
链 F
212–398（187 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM HEPES (pH 7.8), 230mM Li2SO4, 20%-24% (w/v) PEG 3350
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分辨率 2.64 Å R-free 0.280 |
| 6L9J Structure of yeast Snf5 and Swi3 subcomplex 提交 2019-11-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
212–398（187 aa）
链 I
212–398（187 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM HEPES (pH 7.8), 230mM Li2SO4, 20%-24% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.280 |
| 6L9J Structure of yeast Snf5 and Swi3 subcomplex 提交 2019-11-10 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
212–398（187 aa）
链 L
212–398（187 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM HEPES (pH 7.8), 230mM Li2SO4, 20%-24% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.280 |
| 6UXV SWI/SNF Body Module 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 D
1–825（825 aa）
链 E
1–825（825 aa）
链 F
1–825（825 aa）
链 G
1–825（825 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；10 mM HEPES, pH 7.9, 10 mM MgCl2, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 5% glycerol, 0.05% NP-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.70 Å |
| 6UXW SWI/SNF nucleosome complex with ADP-BeFx 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–825（825 aa）
链 E
1–825（825 aa）
链 F
1–825（825 aa）
链 G
1–825（825 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 12 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；10 mM HEPES, pH 7.9, 10 mM MgCl2, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 5% glycerol, 0.05% NP-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 8.96 Å |
| 7C4J Cryo-EM structure of the yeast Swi/Snf complex in a nucleosome free state 提交 2020-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
1–825（825 aa）
链 D
1–825（825 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.89 Å |
| 7EGM The SRM module of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
1–825（825 aa）
链 E
1–825（825 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.60 Å |
| 7EGP The structure of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–825（825 aa）
链 E
1–825（825 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.90 Å |