当前蛋白身份：P32776
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Y5O NMR structure of the amino-terminal domain from the Tfb1 subunit of yeast TFIIH 提交 2004-12-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–115（115 aa）
片段：sequence database residues 1-115
|
突变：M1P | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM SODIUM PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.2 MM TFB1 [UNLABELED], 20 MM PHOSPHATE BUFFER, 1MM EDTA, 100% D2O; 1.2 MM TFB1 [U-15N], 20 MM PHOSPHATE BUFFER, 1MM EDTA, 90% H2O, 10% D2O; 1.2 MM TFB1 [U-15N,13C], 20 MM PHOSPHATE BUFFER, 1MM EDTA, 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2GS0 NMR structure of the complex between the PH domain of the Tfb1 subunit from TFIIH and the activation domain of p53 提交 2006-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–115（115 aa）
|
突变：M1P | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
1.0 mM Tfb1 U-15N,
1.0 mM p53 unlabeled,
1.00 mM EDTA,
20 mM phosphate buffer;
90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM Tfb1 U-15N,13C,
1.0 mM p53 unlabeled,
1.00 mM EDTA,
20 mM phosphate buffer;
100% D20 | 100% D20
NMR样品组成
1.0 mM p53 U-15N,
1.0 mM Tfb1 unlabeled,
1.00 mM EDTA,
20 mM phosphate buffer;
90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM p53 U-15N,
1.0 mM Tfb1 unlabeled,
1.00 mM EDTA,
20 mM phosphate buffer;
100% D20 | 100% D20
|
分辨率未提供 |
| 2K2U NMR Structure of the complex between Tfb1 subunit of TFIIH and the activation domain of VP16 提交 2008-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–115（115 aa）
片段：PH domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Sodium Phosphate；压力 Ambient
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 15N] Tfb1, 1.0 mM VP16, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Tfb1, 1.0 mM VP16, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 15N] VP16, 1.0 mM Tfb1, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] VP16, 1.0 mM Tfb1, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L2I NMR Structure of the complex between the Tfb1 subunit of TFIIH and the activation domain of EKLF 提交 2010-08-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–115（114 aa）
片段：PH domain (UNP residues 2-115)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Sodium Phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] Tfb1, 2 mM EKLF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tfb1, 2 mM EKLF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 15N] EKLF, 1.2 mM Tfb1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] EKLF, 1.2 mM Tfb1, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] EKLF, 1.2 mM Tfb1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tfb1, 2 mM EKLF, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LOX NMR structure of the complex between the PH domain of the Tfb1 subunit from TFIIH and Rad2 提交 2012-01-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–115（114 aa）
片段：UNP residues 2-115
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tfb1, 1.25 mM Rad2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tfb1, 1.25 mM Rad2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] Tfb1, 1.25 mM Rad2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.25 mM Tfb1, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Rad2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.25 mM Tfb1, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Rad2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1.25 mM Tfb1, 1 mM [U-100% 15N] Rad2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M14 NMR structure of the complex between the PH domain of the Tfb1 subunit from TFIIH and Rad4 提交 2012-11-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–115（114 aa）
片段：UNP residues 2-115
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tfb1, 1.25 mM Rad4, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tfb1, 1.25 mM Rad4, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] Tfb1, 1.25 mM Rad4, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.25 mM Tfb1, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Rad4, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.25 mM Tfb1, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Rad4, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1.25 mM Tfb1, 1 mM [U-100% 15N] Rad4, 20 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MKR Structural Characterization of a Complex Between the Acidic Transactivation Domain of EBNA2 and the Tfb1/p62 subunit of TFIIH. 提交 2014-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–115（115 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.7 mM [U-13C; U-15N] Tfb1, 2.1 mM EBNA2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-15N] Tfb1, 2.1 mM EBNA2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-13C; U-15N] Tfb1, 2.1 mM EBNA2, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] EBNA2, 1.5 mM Tfb1, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 15N] EBNA2, 1.5 mM Tfb1, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] EBNA2, 1.5 mM Tfb1, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT-24, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N0Y NMR structure of the complex between the C-terminal domain of the Rift Valley fever virus protein NSs and the PH domain of the Tfb1 subunit of TFIIH 提交 2015-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–115（115 aa）
片段：Pleckstrin homology domain residues 1-115
|
突变：M1P | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 2 mM Non-structural protein NS-S, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 2 mM Non-structural protein NS-S, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-15N] RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 1 mM Non-structural protein NS-S, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 0.5 mM [U-13C; U-15N] Non-structural protein NS-S, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 1 mM [U-13C; U-15N] Non-structural protein NS-S, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4 mM RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 0.2 mM [U-15N] Non-structural protein NS-S, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N23 NMR structure of the complex between the PH domain of the Tfb1 subunit from TFIIH and the N-terminal activation domain of EKLF (TAD1) 提交 2015-04-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–115（114 aa）
片段：Pleckstrin homology domain, UNP residues 2-115
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 2 mM N-terminal transactivation domain of Krueppel-like factor 1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 2 mM N-terminal transactivation domain of Krueppel-like factor 1, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] N-terminal transactivation domain of Krueppel-like factor 1, 2 mM RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] N-terminal transactivation domain of Krueppel-like factor 1, 2 mM RNA polymerase II transcription factor B subunit 1, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5OQJ STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH 提交 2017-08-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–218（218 aa）
链 1
250–295（46 aa）
链 1
537–642（106 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE BLOTTED FOR 8 S AND PLUNGE-FROZEN IN LIQUID ETHANE.
|
分辨率 4.70 Å |
| 5OQM STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR 提交 2017-08-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric（46） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–121（121 aa）
链 1
176–218（43 aa）
链 1
250–295（46 aa）
链 1
522–642（121 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 8 s and plunge-frozen in liquid ethane.
|
分辨率 5.80 Å |
| 5URN NMR structure of the complex between the PH domain of the Tfb1 subunit from TFIIH and the transactivation domain 1 of p65 提交 2017-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–115（114 aa）
片段：PLECKSTRIN HOMOLOGY DOMAIN, UNP RESIDUES 2-115
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION FACTOR B SUBUNIT 1, 1.6 mM TRANSCRIPTION FACTOR P65, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TRANSCRIPTION FACTOR P65, 1.6 mM RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION FACTOR B SUBUNIT 1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION FACTOR B SUBUNIT 1, 1.6 mM TRANSCRIPTION FACTOR P65, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TRANSCRIPTION FACTOR P65, 1.6 mM RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION FACTOR B SUBUNIT 1, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6GYM Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (CCdist) 提交 2018-06-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–218（218 aa）
链 1
250–295（46 aa）
链 1
537–642（106 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 7K01 Structure of TFIIH in TFIIH/Rad4-Rad23-Rad33 DNA opening complex 提交 2020-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；Sample dialyzed for 30 minutes into above buffer prior to grid making
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 2-3 seconds prior to plunge freezing
|
分辨率 3.90 Å |
| 7K04 Structure of TFIIH/Rad4-Rad23-Rad33/DNA in DNA opening 提交 2020-09-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 1
2–642（641 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manually blotted by Leica EM CPC
|
分辨率 9.25 Å |
| 7M2U Nucleotide Excision Repair complex TFIIH Rad4-33 提交 2021-03-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 7O4I Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with initial transcription bubble 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7O4J Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex (consensus) 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7O4K Yeast TFIIH in the contracted state within the pre-initiation complex 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 10 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7O4L Yeast TFIIH in the expanded state within the pre-initiation complex 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 11 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7O72 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed promoter DNA 提交 2021-04-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7O73 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed distorted promoter DNA 提交 2021-04-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7O75 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
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未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric（38） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric（38） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric（38） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.60 Å |
| 8UOQ Composite map of PIC_delta_TFIIK form2 提交 2023-10-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |
| 8UOT Composite map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–642（642 aa）
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未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6
50 mM KOAc
5 mM DTT
2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |