当前蛋白身份:P37330
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D8C MALATE SYNTHASE G COMPLEXED WITH MAGNESIUM AND GLYOXYLATE 提交 1999-10-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–722(722 aa)
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突变:S2A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SOR sorbitol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 GLV GLYOXYLIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;ammonium sulfate, sorbitol, imidazole, magnesium, DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.00 Å |
| 1P7T Structure of Escherichia coli malate synthase G:pyruvate:acetyl-Coenzyme A abortive ternary complex at 1.95 angstrom resolution 提交 2003-05-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–722(722 aa)
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突变:S2A, C-terminal LEHHHHHH tag 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 1 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 PYR PYRUVIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.9;298 K;MgCl2, Tris, DTT, pyruvate, acetyl-Coenzyme A, HEPES, PEG-8000, sodium acetate, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
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分辨率 1.95 Å R-free 0.294 |
| 1P7T Structure of Escherichia coli malate synthase G:pyruvate:acetyl-Coenzyme A abortive ternary complex at 1.95 angstrom resolution 提交 2003-05-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–722(722 aa)
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突变:S2A, C-terminal LEHHHHHH tag 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 1 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 PYR PYRUVIC ACID × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.9;298 K;MgCl2, Tris, DTT, pyruvate, acetyl-Coenzyme A, HEPES, PEG-8000, sodium acetate, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
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分辨率 1.95 Å R-free 0.294 |
| 1Y8B Solution NMR-Derived Global Fold of Malate Synthase G from E.coli 提交 2004-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–722(722 aa)
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突变:S2A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1;310 K;离子强度(mmCIF原始值)25 mM sodium phosphate; 20 mM Magnesium Chloride;压力 ambient
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分辨率未提供 |
| 2JQX Solution structure of Malate Synthase G from joint refinement against NMR and SAXS data 提交 2007-06-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–723(723 aa)
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突变:S2A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.1;293 K;离子强度(mmCIF原始值)170;压力 ambient
NMR样品组成
0.17 mM [U-100% 15N], Ile CD1-[13CH3] MALATE SYNTHASE G, 20 mM sodium phosphate, 5 mM DTT, 150 mM sodium chloride, 100% H2O | 100% H2O
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分辨率未提供 |
| 7YQM 2.9-angstrom cryo-EM structure of Ecoli malate synthase G 提交 2022-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–723(723 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.89 Å |
| 7YQN Crystal structure of Ecoli malate synthase G 提交 2022-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–723(723 aa)
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;19-22% PEG4000, 0.2M NaCl, 0.1M Tris pH 7.6-8.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.172 |
| 7YQN Crystal structure of Ecoli malate synthase G 提交 2022-08-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–723(723 aa)
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;19-22% PEG4000, 0.2M NaCl, 0.1M Tris pH 7.6-8.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.172 |