当前蛋白身份：P38247
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3LGO Structure of Gse1p, member of the GSE/EGO complex 提交 2010-01-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–162（162 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3；293 K；100 mM sodium citrate buffer, pH 2.0, 500-800 mM ammonium sulfate,
200 mM lithium sulfate, 200-350 mM L-arginine-HCl, pH 5.75, 5% DMSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.351 |
| 3LGO Structure of Gse1p, member of the GSE/EGO complex 提交 2010-01-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–162（162 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3；293 K；100 mM sodium citrate buffer, pH 2.0, 500-800 mM ammonium sulfate,
200 mM lithium sulfate, 200-350 mM L-arginine-HCl, pH 5.75, 5% DMSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.351 |
| 4FTX Crystal structure of Ego3 homodimer 提交 2012-06-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–162（162 aa）
链 B
1–162（162 aa）
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未记录 | SIN SUCCINIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；35% tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 4FUW Crystal structure of Ego3 mutant 提交 2012-06-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–162（162 aa）
链 B
1–162（162 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M ammonium sulfate, 0.1M MES monohydrate, 10% 1,4-dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.253 |
| 4XPM Crystal structure of EGO-TC 提交 2015-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–162（162 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.2M NaCl, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 25% PEG 3350
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分辨率 2.40 Å R-free 0.217 |
| 6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–162（162 aa）
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未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.285 |
| 6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 J
1–162（162 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000
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分辨率 3.20 Å R-free 0.285 |
| 9H4Q Cryo-EM structure of the SEAC wing - EGOC 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–162（162 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric（32） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–162（162 aa）
链 Z
1–162（162 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |