当前蛋白身份：P38968
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2PM6 Crystal Structure of yeast Sec13/31 edge element of the COPII vesicular coat, native version 提交 2007-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
370–763（394 aa）
片段：residues 370-763
链 C
370–763（394 aa）
片段：residues 370-763
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 4000, 10% DMSO, 6% dioxanie, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.301 |
| 2PM7 Crystal structure of yeast Sec13/31 edge element of the COPII vesicular coat, selenomethionine version 提交 2007-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
370–763（394 aa）
片段：residues 370-763
链 C
370–763（394 aa）
片段：residues 370-763
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 4000, 10% DMSO, 6% dioxane, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.298 |
| 2PM9 Crystal structure of yeast Sec13/31 vertex element of the COPII vesicular coat 提交 2007-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–411（411 aa）
片段：residues 1-411
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；8% PEG 3350, 0.1M tri-sodium citrate, 10mM manganese chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.305 |
| 2QTV Structure of Sec23-Sar1 complexed with the active fragment of Sec31 提交 2007-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
899–947（49 aa）
片段：residues 899-947
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；295 K；150 mM NaCl, 20 mM HEPES, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.262 |
| 3MZL Sec13/Sec31 edge element, loop deletion mutant 提交 2010-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
370–473（104 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
链 B
508–746（239 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
链 D
370–473（104 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
链 D
508–746（239 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M sodium citrate, 16% polyethylene glycol 3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.300 |
| 3MZL Sec13/Sec31 edge element, loop deletion mutant 提交 2010-05-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
370–473（104 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
链 F
508–746（239 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
链 H
370–473（104 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
链 H
508–746（239 aa）
片段：UNP residues 370-746, deletion of residues 474-507
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M sodium citrate, 16% polyethylene glycol 3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.300 |
| 4BZJ The structure of the COPII coat assembled on membranes 提交 2013-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1273（1273 aa）
链 C
1–1273（1273 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2；pH 6.8；HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE; HOMEMADE PLUNGER
|
分辨率 40.00 Å |
| 4BZK The structure of the COPII coat assembled on membranes 提交 2013-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1273（1273 aa）
链 C
1–1273（1273 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2；pH 6.8；HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE; HOMEMADE PLUNGER
|
分辨率 40.00 Å |
| 6ZG5 COPII on membranes, outer coat right-handed rod, class1 提交 2020-06-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1273（1273 aa）
链 C
1–1273（1273 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 40.00 Å |
| 6ZG6 COPII on membranes, outer coat vertex 提交 2020-06-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1273（1273 aa）
链 C
1–1273（1273 aa）
链 E
1–1273（1273 aa）
链 G
1–1273（1273 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 12.00 Å |
| 6ZL0 COPII on membranes, outer coat left-handed rod 提交 2020-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1273（1273 aa）
链 C
1–1273（1273 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 40.00 Å |