当前蛋白身份：P40359
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–213（213 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 4.70 Å |
| 3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.331 |
| 3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 4.80 Å |
| 5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å R-free 0.391 |
| 5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å R-free 0.394 |
| 6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 B
1–213（213 aa）
链 b
1–213（213 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 B
1–213（213 aa）
链 b
1–213（213 aa）
链 o
1–213（213 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric（18） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
片段：Csm3
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing
in liquid ethane.
|
分辨率 3.70 Å |
| 6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–200（198 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
片段：Csm3
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
|
分辨率 3.20 Å |
| 8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–213（213 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–213（213 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–213（213 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.07 Å |
| 8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric（18） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
|
分辨率 4.23 Å |
| 8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric（18） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
|
分辨率 4.52 Å |
| 8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–213（213 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–213（213 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–213（213 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
|
分辨率 4.12 Å |
| 8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
|
分辨率 7.39 Å |
| 9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
|
分辨率 3.30 Å |
| 9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
|
分辨率 3.50 Å |
| 9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–213（213 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
|
分辨率 3.20 Å |
| 9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric（19） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–213（213 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–213（213 aa）
链 P
1–213（213 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |