当前蛋白身份：P40427
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B8I STRUCTURE OF THE HOMEOTIC UBX/EXD/DNA TERNARY COMPLEX 提交 1999-02-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
238–300（63 aa）
片段：HOMEODOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；0.6M AMMONIUM PHOSPHATE, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.40 Å R-free 0.304 |
| 2R5Y Structure of Scr/Exd complex bound to a consensus Hox-Exd site 提交 2007-09-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
238–300（63 aa）
片段：Homeobox TALE-type DNA-binding domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；277 K；20% MPD, 10-14% PEG 4000, 0.2M sodium acetate, 0.2M potassium chloride, 0.1M Tris , pH 8.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.299 |
| 2R5Z Structure of Scr/Exd complex bound to a DNA sequence derived from the fkh gene 提交 2007-09-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
238–300（63 aa）
片段：Homeobox TALE-type DNA-binding domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.7；10-14 % PEG 4K, 20 % MPD, 0.1 M Tris, pH 8.7-8.9, 0.2 M Sodium Acetate, 0.2 M Potassium Chloride
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分辨率 2.60 Å R-free 0.303 |
| 4CYC CRYSTAL STRUCTURE OF A UBX-EXD-DNA COMPLEX INCLUDING THE HEXAPEPTIDE AND UBDA MOTIFS 提交 2014-04-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
238–312（75 aa）
片段：HOMEODOMAIN RESIDUES 238-312
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1 M AMMONIUM PHOSPHATE, pH 7.5
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分辨率 2.36 Å R-free 0.227 |
| 4UUS CRYSTAL STRUCTURE OF A UBX-EXD-DNA COMPLEX INCLUDING THE UBDA MOTIF 提交 2014-07-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
238–312（75 aa）
片段：HOMEODOMAIN RESIDUES 238-312
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；0.2M AMONIUM SULFATE, 0.1 M TRI-SODIUM-CITRATE PH 4.5, 4% P4000
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分辨率 2.55 Å R-free 0.239 |
| 4UUS CRYSTAL STRUCTURE OF A UBX-EXD-DNA COMPLEX INCLUDING THE UBDA MOTIF 提交 2014-07-31 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
238–312（75 aa）
片段：HOMEODOMAIN RESIDUES 238-312
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；0.2M AMONIUM SULFATE, 0.1 M TRI-SODIUM-CITRATE PH 4.5, 4% P4000
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.239 |
| 5ZJQ Structure of AbdB/Exd complex bound to a 'Red14' DNA sequence 提交 2018-03-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
237–310（74 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；200mM MgCl2, 0.1M Tris pH 5.8, 17.5% PEG 4000, 5% glycerol
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分辨率 2.44 Å R-free 0.252 |
| 5ZJR Structure of AbdB/Exd complex bound to a 'Magenta14' DNA sequence 提交 2018-03-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
237–310（74 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；90mM MgCl2, 0.1M Tris pH9.0, 22% PEG 3350
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分辨率 3.03 Å R-free 0.288 |
| 5ZJS Structure of AbdB/Exd complex bound to a 'Blue14' DNA sequence 提交 2018-03-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
237–310（74 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200mM MgCl2, 0.1M Tris pH 5.8, 17.5% PEG 3350, 2.5% glycerol
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分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 5ZJT Structure of AbdB/Exd complex bound to a 'Black14' DNA sequence 提交 2018-03-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
237–310（74 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M Sodium citrate pH 5.3, 25% PEG 3350
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分辨率 2.40 Å R-free 0.276 |
| 7YB4 Solution structure of homeodomain of EXTRADENTICLE 提交 2022-06-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
238–300（63 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成
0.6 mM [U-13C; U-15N] Homeobox protein Extradenticle, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-13C; U-15N] Homeobox protein Extradenticle, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |