当前蛋白身份:P42575 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1PYO Crystal Structure of Human Caspase-2 in Complex with Acetyl-Leu-Asp-Glu-Ser-Asp-cho 提交 2003-07-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 167–333(167 aa) 片段:subunit p18, sequence database residues 151-316
链 B 348–452(105 aa) 片段:subunit p12, sequence database residues 331-435
链 C 167–333(167 aa) 片段:subunit p18, sequence database residues 151-316
链 D 348–452(105 aa) 片段:subunit p12, sequence database residues 331-435
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;PEG 6000, MOPS, DTT, SUCROSE, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.65 Å R-free 0.213
2P2C Inhibition of caspase-2 by a designed ankyrin repeat protein (DARPin) 提交 2007-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 B 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
链 C 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 D 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;293 K;17% PEG 5000-MME, 0.1 M Tris-HOAc, 0.1 M KSCN, 30% ethylene glycol, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.305
2P2C Inhibition of caspase-2 by a designed ankyrin repeat protein (DARPin) 提交 2007-03-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 F 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
链 G 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 H 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;293 K;17% PEG 5000-MME, 0.1 M Tris-HOAc, 0.1 M KSCN, 30% ethylene glycol, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.305
2P2C Inhibition of caspase-2 by a designed ankyrin repeat protein (DARPin) 提交 2007-03-07 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 I 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 J 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
链 K 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 L 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;293 K;17% PEG 5000-MME, 0.1 M Tris-HOAc, 0.1 M KSCN, 30% ethylene glycol, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.305
3R5J Crystal structure of active caspase-2 bound with Ac-ADVAD-CHO 提交 2011-03-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.77 Å R-free 0.218
3R5J Crystal structure of active caspase-2 bound with Ac-ADVAD-CHO 提交 2011-03-18 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.77 Å R-free 0.218
3R5J Crystal structure of active caspase-2 bound with Ac-ADVAD-CHO 提交 2011-03-18 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.77 Å R-free 0.218
3R6G Crystal structure of active caspase-2 bound with Ac-VDVAD-CHO 提交 2011-03-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.07 Å R-free 0.210
3R6G Crystal structure of active caspase-2 bound with Ac-VDVAD-CHO 提交 2011-03-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.07 Å R-free 0.210
3R6G Crystal structure of active caspase-2 bound with Ac-VDVAD-CHO 提交 2011-03-21 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.07 Å R-free 0.210
3R6L Caspase-2 T380A bound with Ac-VDVAD-CHO 提交 2011-03-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
突变:T380A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
3R6L Caspase-2 T380A bound with Ac-VDVAD-CHO 提交 2011-03-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
突变:T380A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
3R6L Caspase-2 T380A bound with Ac-VDVAD-CHO 提交 2011-03-21 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
突变:T380A 突变:T380A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
3R7B Caspase-2 bound to one copy of Ac-DVAD-CHO 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES (pH 7.0), 15% PEG 3350, 3mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.217
3R7N Caspase-2 bound with two copies of Ac-DVAD-CHO 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.33 Å R-free 0.227
3R7N Caspase-2 bound with two copies of Ac-DVAD-CHO 提交 2011-03-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.33 Å R-free 0.227
3R7N Caspase-2 bound with two copies of Ac-DVAD-CHO 提交 2011-03-22 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa)
链 B 349–452(104 aa)
链 C 175–333(159 aa)
链 D 349–452(104 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.33 Å R-free 0.227
3R7S Crystal Structure of Apo Caspase2 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa) 片段:UNP residues 175-333
链 B 349–452(104 aa) 片段:UNP residues 349-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.226
3R7S Crystal Structure of Apo Caspase2 提交 2011-03-22 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 175–333(159 aa) 片段:UNP residues 175-333
链 D 349–452(104 aa) 片段:UNP residues 349-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.226
3R7S Crystal Structure of Apo Caspase2 提交 2011-03-22 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 175–333(159 aa) 片段:UNP residues 175-333
链 B 349–452(104 aa) 片段:UNP residues 349-452
链 C 175–333(159 aa) 片段:UNP residues 175-333
链 D 349–452(104 aa) 片段:UNP residues 349-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1M HEPES, 15% PEG 3350, 3mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.226
3RJM CASPASE2 IN COMPLEX WITH CHDI LIGAND 33c 提交 2011-04-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 B 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
链 C 167–333(167 aa) 片段:Residues 167-333
链 D 348–452(105 aa) 片段:Residues 348-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;290 K;26% PEG 3500, 100MM MES PH 6.5 - PH 7.0, SITTING DROP, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 290K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.55 Å R-free 0.249
6S9K Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 peptide containing 14-3-3 binding motif Ser139 and NLS 提交 2019-07-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 135–168(34 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CFH 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;PEG 400, calcium chloride, HEPES, 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol
分辨率 1.60 Å R-free 0.221
6SAD Structure of 14-3-3 gamma in complex with double phosphorylated caspase-2 peptide on Ser139 and Ser164 提交 2019-07-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 135–168(34 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293.15 K;PEG 400, magnesium chloride, HEPES, 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol
分辨率 2.75 Å R-free 0.271
8VP4 Crystal Structure of JF1cpCasp2 with Peptide Inhibitor AcVDVAD-CHO 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 334–448(115 aa)
链 A 176–333(158 aa)
链 B 334–448(115 aa)
链 B 176–333(158 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;0.1 M Tris, pH 8.0, 0.2 M Sodium chloride, 20% w/v PEG 6000
分辨率 1.51 Å R-free 0.214
9C2Y Crystal Structure of JF1cpCasp2 in complex with MUR-65 提交 2024-05-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 334–448(115 aa)
链 A 177–333(157 aa)
链 B 334–448(115 aa)
链 B 177–333(157 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Tris, pH 8.0, 0.2 M Sodium chloride, 20% w/v PEG 6000
分辨率 1.96 Å R-free 0.248
9C2Y Crystal Structure of JF1cpCasp2 in complex with MUR-65 提交 2024-05-31 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 334–448(115 aa)
链 C 177–333(157 aa)
链 D 334–448(115 aa)
链 D 177–333(157 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Tris, pH 8.0, 0.2 M Sodium chloride, 20% w/v PEG 6000
分辨率 1.96 Å R-free 0.248