当前蛋白身份：P42684
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2ECD Solution structure of the human ABL2 SH2 domain 提交 2007-02-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
163–268（106 aa）
片段：SH2 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.33mM SH2 domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2KK1 Solution structure of C-terminal Domain of Tyrosine-protein kinase ABL2 from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) target HR5537A 提交 2009-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1058–1182（125 aa）
片段：sequence database residues 1058-1182
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成
1.2 mM [U-100% 15N] protein, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1.2 mM [U-10% 13C; U-100% 15N] protein, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 2XYN HUMAN ABL2 IN COMPLEX WITH AURORA KINASE INHIBITOR VX-680 提交 2010-11-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–510（268 aa）
片段：RESIDUES 243-510
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未记录 | NA SODIUM ION × 2 VX6 CYCLOPROPANECARBOXYLIC ACID {4-[4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YL)-6-(5-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YLAMINO)-PYRIMIDIN-2-YLSULFANYL]-PHENYL}-AMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.8M SODIUM SUCCINATE, PH 7, VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.284 |
| 2XYN HUMAN ABL2 IN COMPLEX WITH AURORA KINASE INHIBITOR VX-680 提交 2010-11-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
243–510（268 aa）
片段：RESIDUES 243-510
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未记录 | VX6 CYCLOPROPANECARBOXYLIC ACID {4-[4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YL)-6-(5-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YLAMINO)-PYRIMIDIN-2-YLSULFANYL]-PHENYL}-AMIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.8M SODIUM SUCCINATE, PH 7, VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.284 |
| 2XYN HUMAN ABL2 IN COMPLEX WITH AURORA KINASE INHIBITOR VX-680 提交 2010-11-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
243–510（268 aa）
片段：RESIDUES 243-510
|
未记录 | VX6 CYCLOPROPANECARBOXYLIC ACID {4-[4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YL)-6-(5-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YLAMINO)-PYRIMIDIN-2-YLSULFANYL]-PHENYL}-AMIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.8M SODIUM SUCCINATE, PH 7, VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.284 |
| 3GVU The crystal structure of human ABL2 in complex with GLEEVEC 提交 2009-03-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–546（268 aa）
片段：Protein kinase
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未记录 | STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG3350, 0.1M citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.226 |
| 3GVU The crystal structure of human ABL2 in complex with GLEEVEC 提交 2009-03-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
279–546（268 aa）
片段：Protein kinase
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未记录 | STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG3350, 0.1M citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.226 |
| 3HMI The crystal structure of human ABL2 in complex with 5-AMINO-3-{[4-(AMINOSULFONYL)PHENYL]AMINO}-N-(2,6-DIFLUOROPHENYL)-1H-1,2,4-TRIAZOLE-1-CARBOTHIOAMIDE 提交 2009-05-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–546（268 aa）
片段：Protein kinase
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未记录 | DKI 5-AMINO-3-{[4-(AMINOSULFONYL)PHENYL]AMINO}-N-(2,6-DIFLUOROPHENYL)-1H-1,2,4-TRIAZOLE-1-CARBOTHIOAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M lithium sulfate, 0.05M di-sodium hydrogen phosphate, 0.05M citric acid, 19%(w/v) PEG 1000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 1.65 Å R-free 0.234 |
| 3ULR Lysozyme contamination facilitates crystallization of a hetero-trimericCortactin:Arg:Lysozyme complex 提交 2011-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
563–579（17 aa）
片段：PXXP1 (UNP residues 563-579)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；297 K；1.0M Na Citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.225 |
| 4EIH Crystal structure of Arg SH2 domain 提交 2012-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
165–273（109 aa）
片段：SH2 domain, UNP residues 165-273
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；pH8.5 100mM Tris, 15-17% PEG4000 0.2M Na Acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.181 |
| 5NP3 Abl2 SH3 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–166（57 aa）
片段：SH3 domain, UNP Residues 110-166
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M di-sodium-DL-malate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 5NP3 Abl2 SH3 提交 2017-04-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
110–166（57 aa）
片段：SH3 domain, UNP Residues 110-166
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M di-sodium-DL-malate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 5NP3 Abl2 SH3 提交 2017-04-13 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
110–166（57 aa）
片段：SH3 domain, UNP Residues 110-166
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M di-sodium-DL-malate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 5NP3 Abl2 SH3 提交 2017-04-13 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
110–166（57 aa）
片段：SH3 domain, UNP Residues 110-166
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M di-sodium-DL-malate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 5NP5 Abl2 SH3 pTyr116/161 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–166（57 aa）
片段：SH3 domain, UNP Residues 110-166
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M sodium acetate
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分辨率 1.40 Å R-free 0.199 |
| 5NP5 Abl2 SH3 pTyr116/161 提交 2017-04-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
110–166（57 aa）
片段：SH3 domain, UNP Residues 110-166
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.199 |