当前蛋白身份:P43489
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 G
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 H
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 I
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 J
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 K
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 L
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 G
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 H
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 I
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 J
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 K
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 L
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 G
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 H
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 I
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 J
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 K
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
链 L
262–266(5 aa)
片段:TRAF-BINDING SEQUENCE
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 2HEV Crystal structure of the complex between OX40L and OX40 提交 2006-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
29–170(142 aa)
片段:extracellular domain (residues 29-170)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;8% PEG 20000, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.251 |
| 2HEY Crystal structure of murine OX40L bound to human OX40 提交 2006-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
29–170(142 aa)
片段:extracellular domain (residues 29-170)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M NaCl, 1.4 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 2HEY Crystal structure of murine OX40L bound to human OX40 提交 2006-06-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 T
29–170(142 aa)
片段:extracellular domain (residues 29-170)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M NaCl, 1.4 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 6OGX Ternary complex of OX40R (TNFRSF4) bound to Fab1 and Fab2 提交 2019-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 G
29–170(142 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M Tris pH 8.5, 1.5 M D-L malic acid pH 7.0, 0.15 mM dimethylethylammonium propane sulfate (NDSB-195)
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.254 |
| 6OKM Human OX40R (TNFRSF4) bound to Fab 3C8 提交 2019-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 R
29–170(142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 6OKN OX40R (TNFRSF4) bound to Fab 1A7 提交 2019-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 R
29–170(142 aa)
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;tbd
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.228 |
| 6OKN OX40R (TNFRSF4) bound to Fab 1A7 提交 2019-04-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
29–170(142 aa)
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;tbd
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.228 |
| 7YK4 ox40-antibody 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
29–170(142 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M potassium sodium tartrate, 14% PEG 3350, 10% glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.298 |
| 7YK4 ox40-antibody 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
29–170(142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M potassium sodium tartrate, 14% PEG 3350, 10% glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.298 |
| 8AG1 Crystal structure of a novel OX40 antibody 提交 2022-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
29–170(142 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5;293 K;0.1m CITRATE, PH5.6, 2% TACSIMATE, 16% PEG3350
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.268 |
| 8AG1 Crystal structure of a novel OX40 antibody 提交 2022-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 a
29–170(142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5;293 K;0.1m CITRATE, PH5.6, 2% TACSIMATE, 16% PEG3350
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.268 |