当前蛋白身份：P43572
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
50–400（351 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.273 |
| 5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
50–400（351 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.273 |
| 5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 N
50–400（351 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.273 |
| 5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
121–400（280 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.219 |
| 5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
121–400（280 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.219 |
| 5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
121–400（280 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.219 |
| 5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
50–400（351 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.246 |
| 5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
50–400（351 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.246 |
| 5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 N
50–400（351 aa）
片段：UNP residues 50-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.246 |
| 5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
121–400（280 aa）
片段：UNP residues 121-400
|
未记录 | ACO ACETYL COENZYME *A × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
121–400（280 aa）
片段：UNP residues 121-400
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
121–400（280 aa）
片段：UNP residues 121-400
|
未记录 | ACO ACETYL COENZYME *A × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 7VVU NuA4 HAT module bound to the nucleosome 提交 2021-11-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–832（832 aa）
链 X
1–832（832 aa）
|
未记录 | CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.40 Å |
| 7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 H
1–832（832 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.10 Å |
| 7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 H
1–832（832 aa）
链 T
1–832（832 aa）
|
未记录 | CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 8.80 Å |
| 7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
1–832（832 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7YFP The NuA4 histone acetyltransferase complex from S. cerevisiae 提交 2022-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
1–832（832 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
1–832（832 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |