当前蛋白身份：P49687
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 C
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 F
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 G
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 C
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 G
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 C
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 F
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 G
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 C
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
链 G
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
731–1158（428 aa）
片段：Nucleoporin NUP145C
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
731–1158（428 aa）
片段：UNP residues 731-1158
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.273 |
| 3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
731–1158（428 aa）
片段：UNP residues 731-1158
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.273 |
| 3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
731–1158（428 aa）
片段：UNP residues 731-1158
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.273 |
| 3JRO NUP84-NUP145C-SEC13 edge element of the NPC lattice 提交 2009-09-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
714–1160（447 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.15M sodium malonate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.329 |
| 3JRP SEC13 with NUP145C (AA109-179) insertion blade 提交 2009-09-08 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
714–784（71 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；289 K；0.1M Tris, 22% PEG 4000, 0.25 M LiCl, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.254 |
| 3KEP Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
442–605（164 aa）
片段：residues 442 to 605
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES, 25% PEG 3350, 200mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.244 |
| 3KEP Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
442–605（164 aa）
片段：residues 442 to 605
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES, 25% PEG 3350, 200mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.244 |
| 3KES Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae in the Hexagonal, P61 space group 提交 2009-10-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
442–605（164 aa）
片段：residues 442 to 605
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；1600mM tri-sodium citrate dehydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.230 |
| 3KES Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae in the Hexagonal, P61 space group 提交 2009-10-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
442–605（164 aa）
片段：residues 442 to 605
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；1600mM tri-sodium citrate dehydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.230 |
| 4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
680–1317（638 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
|
分辨率 7.38 Å R-free 0.353 |
| 4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
680–1317（638 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
|
分辨率 7.60 Å R-free 0.347 |
| 7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric（136） 与蛋白数一致 |
链 c
606–1317（712 aa）
链 n
606–1317（712 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.60 Å |
| 7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 c
606–1317（712 aa）
链 n
606–1317（712 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.60 Å |
| 7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 c
606–1317（712 aa）
链 n
606–1317（712 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.60 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白数一致 |
链 c
606–1317（712 aa）
链 j
606–1317（712 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白数一致 |
链 c
606–1317（712 aa）
链 j
606–1317（712 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白数一致 |
链 c
606–1317（712 aa）
链 j
606–1317（712 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |