当前蛋白身份:P49767 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2X1W Crystal Structure of VEGF-C in Complex with Domains 2 and 3 of VEGFR2 提交 2010-01-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 112–215(104 aa) 片段:VEGF HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 112-215
链 B 112–215(104 aa) 片段:VEGF HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 112-215
突变:YES 突变:YES CS CESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.2;100 MM MES BUFFER, PH 5.0-5.6, 50 MM CSCL AND 28-32 % (W/V) JEFFAMINE 600.
分辨率 2.70 Å R-free 0.280
2X1W Crystal Structure of VEGF-C in Complex with Domains 2 and 3 of VEGFR2 提交 2010-01-08 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 112–215(104 aa) 片段:VEGF HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 112-215
链 D 112–215(104 aa) 片段:VEGF HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 112-215
突变:YES 突变:YES CS CESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.2;100 MM MES BUFFER, PH 5.0-5.6, 50 MM CSCL AND 28-32 % (W/V) JEFFAMINE 600.
分辨率 2.70 Å R-free 0.280
2X1X CRYSTAL STRUCTURE OF VEGF-C IN COMPLEX WITH DOMAINS 2 AND 3 OF VEGFR2 IN A TETRAGONAL CRYSTAL FORM 提交 2010-01-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 112–215(104 aa) 片段:VEGF HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 112-215
突变:YES HG MERCURY (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6;100 MM NA-ACETATE BUFFER, PH 4.4-4.8, 50 MM CSCL, 28-32 % (W/V) JEFFAMINE 600
分辨率 3.10 Å R-free 0.334
4BSK Crystal structure of VEGF-C in complex with VEGFR-3 domains D1-2 提交 2013-06-10 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 103–215(113 aa) 片段:VEGF HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 103-215
突变:YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;SITTING DROPS AT ROOM TEMPERATURE OVER A RESERVOIR SOLUTION OF 0.1 M BIS-TRIS BUFFER AT PH 8.5-9.5 AND 1.0-1.5 M AMMONIUM SULPHATE.
分辨率 4.20 Å R-free 0.372