当前蛋白身份：P49959
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3T1I Crystal Structure of Human Mre11: Understanding Tumorigenic Mutations 提交 2011-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–411（411 aa）
片段：UNP residues 1-411
链 B
1–411（411 aa）
片段：UNP residues 1-411
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MN MANGANESE (II) ION × 4 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；14% PEG 3350, 0.1M Bicne, 0.5mM manganese chloride, 2mM Dithiothreitol, 4mM Glutathione, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 3T1I Crystal Structure of Human Mre11: Understanding Tumorigenic Mutations 提交 2011-07-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–411（411 aa）
片段：UNP residues 1-411
链 D
1–411（411 aa）
片段：UNP residues 1-411
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MN MANGANESE (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；14% PEG 3350, 0.1M Bicne, 0.5mM manganese chloride, 2mM Dithiothreitol, 4mM Glutathione, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 8BAH Human Mre11-Nbs1 complex 提交 2022-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–708（708 aa）
链 B
1–708（708 aa）
|
突变：H129N 突变：H129N | MN MANGANESE (II) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；20 mM HEPES (pH 7.0), 140 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2, 0.020 mM ZnCl2, 0.2 mM TCEP, 2 mM ATPgS, plus 0.05 percent beta-OG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.13 Å |
| 8K00 RPA70N-MRE11 fusion 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
538–563（26 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Ammonium sulate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.199 |
| 9Q9H Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50 complex bound to DNA 提交 2025-02-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–708（708 aa）
链 E
1–708（708 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 9Q9I Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50-Nbs1 complex bound to DNA 提交 2025-02-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–708（708 aa）
链 E
1–708（708 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9Q9J Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN) complex bound to DNA and telomeric factor TRF2 fragment (438-542) 提交 2025-02-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–708（708 aa）
链 E
1–708（708 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.71 Å |
| 9Q9K Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50 (MR) complex bound to DNA and telomeric factor TRF2 fragment (438-542) 提交 2025-02-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–708（708 aa）
链 E
1–708（708 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9Q9M Cryo-EM structure of human Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN) complex bound to DNA and telomeric factor TRF2 提交 2025-02-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–708（708 aa）
链 E
1–708（708 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25mM Hepes-NaOH, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1 mM ATP, 1mM BeF3, 5 mM MgCl2, 1 mM MnCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 9ULO Cryo-EM structure of Human Mre11-Nbs1 complex 提交 2025-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–708（708 aa）
链 B
1–708（708 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |