当前蛋白身份：P51587
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1N0W Crystal structure of a RAD51-BRCA2 BRC repeat complex 提交 2002-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1517–1551（35 aa）
片段：BRC repeat type 4
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；ETHYLENE GLYCOL, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.206 |
| 3EU7 Crystal Structure of a PALB2 / BRCA2 complex 提交 2008-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 X
21–39（19 aa）
片段：Interaction with PALB2, residues 21-39
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Na-Cacodylate pH 6.5, 0.2M magnesium acetate, 10% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.253 |
| 7BDX Armadillo domain of HSF2BP in complex with BRCA2 peptide 提交 2020-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
2291–2343（53 aa）
链 F
2291–2343（53 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG 3350 : 16% (w/v)
Mes ph 6.0 100 mM
MgCl2 100 mM
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.241 |
| 7LDG Crystal structure of the MEILB2-BRCA2 complex 提交 2021-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
2271–2335（65 aa）
片段：MEILB2-binding domain (aa2271-2335)
链 D
2271–2335（65 aa）
片段：MEILB2-binding domain (aa2271-2335)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；289 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M lithium acetate
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.231 |
| 8BR9 Stapled peptide SP24 in complex with humanised RadA mutant HumRadA22 提交 2022-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1226–1263（38 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 RF6 4,6-diethylpyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M Na 3 Cit 4.2 pH (Buffer)
20 %w/v PEG 1K
(Precipitant)
0.2 M Li 2 SO4 (Salt)
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.282 |
| 8C3J Stapled peptide SP2 in complex with humanised RadA mutant HumRadA22 提交 2022-12-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1226–1244（19 aa）
链 C
2050–2064（15 aa）
|
未记录 | TKI 2-[(4,6-diethyl-1,3,5-triazin-2-yl)-methyl-amino]ethanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein in 20 mM CHES pH 9.5, 100
mM NaCl.
Condition: 8 % w/v PEG 8000
(precipitant) 0.08 M
Potassium phosphate pH
5.6 (buffer)
200:200 uL drop
|
分辨率 3.02 Å R-free 0.281 |
| 8C3J Stapled peptide SP2 in complex with humanised RadA mutant HumRadA22 提交 2022-12-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
1226–1244（19 aa）
链 J
2050–2064（15 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein in 20 mM CHES pH 9.5, 100
mM NaCl.
Condition: 8 % w/v PEG 8000
(precipitant) 0.08 M
Potassium phosphate pH
5.6 (buffer)
200:200 uL drop
|
分辨率 3.02 Å R-free 0.281 |
| 8C3N Stapled peptide SP30 in complex with humanised RadA mutant HumRadA22 提交 2022-12-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1215–1243（29 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 RF6 4,6-diethylpyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein: 0.5 mM SP30:HumRadA22 in 20 mM CHES pH 9.5, 100 mM NaCl, 20 mM ADP/MgCl 2
Condition:
14% w/v PEG 4000
(precipitant), 6% v/v MPD
(precipitant), 0.1M Na K
Phos pH 6.2 (buffer)
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.218 |
| 8PBC RAD51 filament on ssDNA bound by the BRCA2 c-terminus 提交 2023-06-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 L
3260–3308（49 aa）
链 M
3260–3308（49 aa）
链 N
3260–3308（49 aa）
链 O
3260–3308（49 aa）
链 P
3260–3308（49 aa）
链 Q
3260–3308（49 aa）
链 R
3260–3308（49 aa）
链 S
3260–3308（49 aa）
链 T
3260–3308（49 aa）
链 U
3260–3308（49 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 CA CALCIUM ION × 22 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 8PBD RAD51 filament on dsDNA bound by the BRCA2 c-terminus 提交 2023-06-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 K
3260–3308（49 aa）
链 L
3260–3308（49 aa）
链 M
3260–3308（49 aa）
链 N
3260–3308（49 aa）
链 O
3260–3308（49 aa）
链 P
3260–3308（49 aa）
链 Q
3260–3308（49 aa）
链 R
3260–3308（49 aa）
链 S
3260–3308（49 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 CA CALCIUM ION × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 8QQE Crystal structure of the complex between DMC1 and the PhePP domain of BRCA2 提交 2023-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 C
2398–2417（20 aa）
链 D
2398–2417（20 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1M MES at pH 6, 2.4 M sodium formate
|
分辨率 3.46 Å R-free 0.261 |
| 8R2G Crystal structure of a BRCA2-DMC1 complex 提交 2023-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 I
2400–2413（14 aa）
链 J
2400–2413（14 aa）
链 K
2400–2413（14 aa）
链 L
2400–2413（14 aa）
链 M
2400–2413（14 aa）
链 N
2400–2413（14 aa）
链 O
2400–2413（14 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM HEPES-NaOH pH 7.4, 50 mM MgCl2, 500 mM NaCl, 8 % PEG 3350, 20 % glycerol
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.306 |
| 8UVW Crystal structure of RAD51-BRCA2 Cter complex 提交 2023-11-05 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1517–1547（31 aa）
链 D
3270–3305（36 aa）
|
突变：C319S 突变：S208E,A209D,C3287A,C3304A,C391S | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% v/v 1,4-Dioxane
0.05 M MOPS pH 7.0
0.005 M Magnesium chloride hexahydrate
0.001 M Spermine
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.282 |