当前蛋白身份:P52952 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3RKQ NKX2.5 Homeodomain dimer bound to ANF-242 DNA 提交 2011-04-18 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 138–194(57 aa) 片段:Homeodomain, UNP residues 138-194
链 B 138–194(57 aa) 片段:Homeodomain, UNP residues 138-194
突变:C193S 突变:C193S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50mM Tris pH 7.0, 5mM MgCl2, 15% polyethylene glycol monomethyl ether 550 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.257
4S0H TBX5 DB, NKX2.5 HD, ANF DNA Complex 提交 2014-12-31 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 B 142–194(53 aa) 片段:HD (UNP residues 142-194)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.82 Å R-free 0.247
4S0H TBX5 DB, NKX2.5 HD, ANF DNA Complex 提交 2014-12-31 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 F 142–194(53 aa) 片段:HD (UNP residues 142-194)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.82 Å R-free 0.247
6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 O 137–197(61 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 M 137–197(61 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 3 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 N 137–197(61 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 I 140–196(57 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 N 140–196(57 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251