当前蛋白身份:P52952
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3RKQ NKX2.5 Homeodomain dimer bound to ANF-242 DNA 提交 2011-04-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
138–194(57 aa)
片段:Homeodomain, UNP residues 138-194
链 B
138–194(57 aa)
片段:Homeodomain, UNP residues 138-194
|
突变:C193S 突变:C193S | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50mM Tris pH 7.0, 5mM MgCl2, 15% polyethylene glycol monomethyl ether 550 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.257 |
| 4S0H TBX5 DB, NKX2.5 HD, ANF DNA Complex 提交 2014-12-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 B
142–194(53 aa)
片段:HD (UNP residues 142-194)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.82 Å R-free 0.247 |
| 4S0H TBX5 DB, NKX2.5 HD, ANF DNA Complex 提交 2014-12-31 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 F
142–194(53 aa)
片段:HD (UNP residues 142-194)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.82 Å R-free 0.247 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 O
137–197(61 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 M
137–197(61 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 3 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 N
137–197(61 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 I
140–196(57 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.251 |
| 6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 N
140–196(57 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
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分辨率 2.90 Å R-free 0.251 |