当前蛋白身份：P53608
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDOVELOX, NATIVE STRUCTURE AT PH 5.6 提交 1999-03-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–299（299 aa）
链 B
1–299（299 aa）
链 C
1–299（299 aa）
链 D
1–299（299 aa）
链 E
1–299（299 aa）
链 F
1–299（299 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；3-6% N-BUTANOL,IN 0.1 M SODIUM CITRATE BUFFER, PH 5.6 PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.265 |
| 1CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDOVELOX, NATIVE STRUCTURE AT PH 5.6 提交 1999-03-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–299（299 aa）
链 B
1–299（299 aa）
链 C
1–299（299 aa）
链 D
1–299（299 aa）
链 E
1–299（299 aa）
链 F
1–299（299 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；3-6% N-BUTANOL,IN 0.1 M SODIUM CITRATE BUFFER, PH 5.6 PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.265 |
| 2CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, NATIVE STRUCTURE AT PH 8.5 提交 1999-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–299（298 aa）
链 B
2–299（298 aa）
链 C
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 GAI GUANIDINE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION, MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION. PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,PH 7.5. RESERVOIR SOLUTION 27-30% MONOMETHYLPEG 5000, 10 MM MNCL2, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, IN 0.1 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.238 |
| 2CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, NATIVE STRUCTURE AT PH 8.5 提交 1999-03-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
2–299（298 aa）
链 E
2–299（298 aa）
链 F
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 6 GAI GUANIDINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION, MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION. PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,PH 7.5. RESERVOIR SOLUTION 27-30% MONOMETHYLPEG 5000, 10 MM MNCL2, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, IN 0.1 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.238 |
| 2CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, NATIVE STRUCTURE AT PH 8.5 提交 1999-03-10 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
2–299（298 aa）
链 E
2–299（298 aa）
链 F
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 GAI GUANIDINE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION, MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION. PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,PH 7.5. RESERVOIR SOLUTION 27-30% MONOMETHYLPEG 5000, 10 MM MNCL2, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, IN 0.1 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.238 |
| 3CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, COMPLEXED WITH L-ARGININE 提交 1999-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–299（298 aa）
链 B
2–299（298 aa）
链 C
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 6 ARG ARGININE × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,PH 7.5 RESERVOIR SOLUTION 28% MONOMETHYLPEG 2000, 10 MM EDTA, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, IN 0.05 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8. THE CRYSTALS WERE THEN SOAKED IN 42.5% MMPEG 2000, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, 10 MM L-ARGININE, 10 MM EDTA, 0.05M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5 FOR 8 HOURS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 3CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, COMPLEXED WITH L-ARGININE 提交 1999-03-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
2–299（298 aa）
链 E
2–299（298 aa）
链 F
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 ARG ARGININE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,PH 7.5 RESERVOIR SOLUTION 28% MONOMETHYLPEG 2000, 10 MM EDTA, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, IN 0.05 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8. THE CRYSTALS WERE THEN SOAKED IN 42.5% MMPEG 2000, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, 10 MM L-ARGININE, 10 MM EDTA, 0.05M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5 FOR 8 HOURS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 3CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, COMPLEXED WITH L-ARGININE 提交 1999-03-15 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
2–299（298 aa）
链 E
2–299（298 aa）
链 F
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 6 ARG ARGININE × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,PH 7.5 RESERVOIR SOLUTION 28% MONOMETHYLPEG 2000, 10 MM EDTA, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, IN 0.05 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8. THE CRYSTALS WERE THEN SOAKED IN 42.5% MMPEG 2000, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, 10 MM L-ARGININE, 10 MM EDTA, 0.05M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5 FOR 8 HOURS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 4CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, L-ORNITHINE COMPLEX 提交 1999-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–299（299 aa）
链 B
1–299（299 aa）
链 C
1–299（299 aa）
链 D
1–299（299 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 16 ORN L-ornithine × 12 GAI GUANIDINE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；RESERVOIR SOLUTION 28% MONOMETHYLPEG 2000,
5 MM MNCL2, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, 10 MM
D/L-ORNITHINE,IN 0.05 M BISTRISPROPANE/HCL,PH 8.5
27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPSm, PH 7.5
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 4CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, L-ORNITHINE COMPLEX 提交 1999-03-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–299（299 aa）
链 E
1–299（299 aa）
链 F
1–299（299 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 GAI GUANIDINE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；RESERVOIR SOLUTION 28% MONOMETHYLPEG 2000,
5 MM MNCL2, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, 10 MM
D/L-ORNITHINE,IN 0.05 M BISTRISPROPANE/HCL,PH 8.5
27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPSm, PH 7.5
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 5CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, L-LYSINE COMPLEX 提交 1999-03-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–299（298 aa）
链 B
2–299（298 aa）
链 C
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 LYS LYSINE × 6 GAI GUANIDINE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION
PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,
PH 7.5
RESERVOIR SOLUTION 28% MONOMETHYLPEG 2000,
5 MM MNCL2, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, 10 MM
L-LYSINE, IN 0.05 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.261 |
| 5CEV ARGINASE FROM BACILLUS CALDEVELOX, L-LYSINE COMPLEX 提交 1999-03-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
2–299（298 aa）
链 E
2–299（298 aa）
链 F
2–299（298 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 12 LYS LYSINE × 6 GAI GUANIDINE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；MIXING 2 UL PROTEIN WITH 2 UL RESERVOIR SOLUTION
PROTEIN SOLUTION 27 MG/ML PROTEIN, 10 MM MOPS,
PH 7.5
RESERVOIR SOLUTION 28% MONOMETHYLPEG 2000,
5 MM MNCL2, 10 MM GUANIDINE HYDROCHLORIDE, 10 MM
L-LYSINE, IN 0.05 M BISTRISPROPANE/HCL, PH 8.5
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.261 |