当前蛋白身份:P54253
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1OA8 AXH domain of human spinocerebellar ataxin-1 提交 2003-01-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
563–694(132 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694
链 B
563–694(132 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;290 K;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M TRIS/HCL, PH 7.0, 0.2M AMMONIUM SULPHATE, 5 MM DTT, 15% PEG 4000, 20% GLYCEROL, AT 290K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.252 |
| 1OA8 AXH domain of human spinocerebellar ataxin-1 提交 2003-01-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
563–694(132 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694
链 D
563–694(132 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;290 K;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M TRIS/HCL, PH 7.0, 0.2M AMMONIUM SULPHATE, 5 MM DTT, 15% PEG 4000, 20% GLYCEROL, AT 290K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.252 |
| 2M41 Solution Structure of the AXH domain of Ataxin-1 in complex with ligand peptide from Capicua 提交 2013-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
566–688(123 aa)
片段:AXH domain, native residues A567-K689
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;310 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 4APT The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
链 B
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.4 M POTASSIUM SODIUM TARTRATE AT ROOM TEMPERATURE.
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分辨率 2.50 Å R-free 0.288 |
| 4APT The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
链 D
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.4 M POTASSIUM SODIUM TARTRATE AT ROOM TEMPERATURE.
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分辨率 2.50 Å R-free 0.288 |
| 4AQP The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
链 B
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.1 M MES, PH 6.5, 10% W/V PWG 20000 AT ROOM TEMPERATURE.
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分辨率 2.45 Å R-free 0.267 |
| 4AQP The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
链 D
566–688(123 aa)
片段:AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688
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未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.1 M MES, PH 6.5, 10% W/V PWG 20000 AT ROOM TEMPERATURE.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.267 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
562–688(127 aa)
片段:AXH domain, UNP residues 562-688
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突变:I580M,I605M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
562–688(127 aa)
片段:AXH domain, UNP residues 562-688
|
突变:I580M,I605M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2J Crystal structure of AXH domain complex with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
562–688(127 aa)
片段:AXH domain, UNP residues 562-688
|
突变:I580M,I605M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
562–688(127 aa)
片段:AXH domain, UNP residues 562-688
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
562–688(127 aa)
片段:AXH domain, UNP residues 562-688
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |