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蛋白结构与聚集状态

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当前蛋白身份：P54921 重新检索
22PDB条目
22Biological assembly
75链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3J96 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State I) 提交 2014-12-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致
链 G 1–295（295 aa）
链 H 1–295（295 aa）
链 I 1–295（295 aa）
链 J 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging；90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 7.60 Å R-free 0.303
3J97 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State II) 提交 2014-12-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致
链 G 1–295（295 aa）
链 H 1–295（295 aa）
链 I 1–295（295 aa）
链 J 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging；90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 7.80 Å R-free 0.311
3J98 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State IIIa) 提交 2014-12-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致
链 G 1–295（295 aa）
链 H 1–295（295 aa）
链 I 1–295（295 aa）
链 J 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging.；90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 8.40 Å R-free 0.328
3J99 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State IIIb) 提交 2014-12-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致
链 G 1–295（295 aa）
链 H 1–295（295 aa）
链 I 1–295（295 aa）
链 J 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging.；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 8.20 Å R-free 0.304
6MDM The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 1) 提交 2018-09-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.
分辨率 4.40 Å
6MDN The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 2) 提交 2018-09-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致
链 K 1–278（278 aa）
链 L 1–278（278 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.
分辨率 4.40 Å
9OJZ 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 5 提交 2025-05-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9OK3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), 3:2:1 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 13 提交 2025-05-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致
链 F 1–295（295 aa）
链 G 1–295（295 aa）
链 H 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9OLO 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 19 提交 2025-05-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
链 M 1–295（295 aa）
链 N 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9OM6 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, hydrolyzing, class 23 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致
链 E 1–295（295 aa）
链 F 1–295（295 aa）
链 G 1–295（295 aa）
链 H 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9PAF 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 6 提交 2025-06-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9PAG 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 7 提交 2025-06-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9PB9 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 8 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
9PBA 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 9 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9PBF 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 10 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.01 Å
9PBV 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 11 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 I 1–295（295 aa）
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
9PC3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 12 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
9PCZ 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 15 提交 2025-06-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致
链 M 1–295（295 aa）
链 N 1–295（295 aa）
链 O 1–295（295 aa）
链 P 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9PD1 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 20 提交 2025-06-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
链 M 1–295（295 aa）
链 N 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
9PDD 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 29 提交 2025-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致
链 I 1–295（295 aa）
链 J 1–295（295 aa）
链 K 1–295（295 aa）
链 L 1–295（295 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
9PFF Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), non-hydrolyzing, class 27 提交 2025-07-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致
链 L 1–295（295 aa）
链 M 1–295（295 aa）
链 N 1–295（295 aa）
链 O 1–295（295 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9PFG Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a H3-SNAP-25 SN1 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 28 提交 2025-07-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致
链 E 1–295（295 aa）
链 F 1–295（295 aa）
链 G 1–295（295 aa）
链 H 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。