当前蛋白身份：P55210
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1F1J CRYSTAL STRUCTURE OF CASPASE-7 IN COMPLEX WITH ACETYL-ASP-GLU-VAL-ASP-CHO 提交 2000-05-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；30% PEG 4000, 0.1 M Na-citrate, 0.2 M ammonium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.263 |
| 1F1J CRYSTAL STRUCTURE OF CASPASE-7 IN COMPLEX WITH ACETYL-ASP-GLU-VAL-ASP-CHO 提交 2000-05-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；30% PEG 4000, 0.1 M Na-citrate, 0.2 M ammonium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.263 |
| 1F1J CRYSTAL STRUCTURE OF CASPASE-7 IN COMPLEX WITH ACETYL-ASP-GLU-VAL-ASP-CHO 提交 2000-05-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
链 B
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；30% PEG 4000, 0.1 M Na-citrate, 0.2 M ammonium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.263 |
| 1F1J CRYSTAL STRUCTURE OF CASPASE-7 IN COMPLEX WITH ACETYL-ASP-GLU-VAL-ASP-CHO 提交 2000-05-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
链 B
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；30% PEG 4000, 0.1 M Na-citrate, 0.2 M ammonium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.263 |
| 1F1J CRYSTAL STRUCTURE OF CASPASE-7 IN COMPLEX WITH ACETYL-ASP-GLU-VAL-ASP-CHO 提交 2000-05-19 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
链 B
2–303（302 aa）
片段：P20/P10 CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；30% PEG 4000, 0.1 M Na-citrate, 0.2 M ammonium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.263 |
| 1GQF Crystal structure of human procaspase-7 提交 2001-11-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
47–303（257 aa）
链 B
47–303（257 aa）
|
突变：C187A 突变：C187A | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；293 K；50 MM MES, PH 5.6, 10 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 100 MM AMMONIUM SULFATE, 20% (W/V) PEG 8000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.285 |
| 1I4O CRYSTAL STRUCTURE OF THE XIAP/CASPASE-7 COMPLEX 提交 2001-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–303（280 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 1I4O CRYSTAL STRUCTURE OF THE XIAP/CASPASE-7 COMPLEX 提交 2001-02-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
24–303（280 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 1I4O CRYSTAL STRUCTURE OF THE XIAP/CASPASE-7 COMPLEX 提交 2001-02-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
24–303（280 aa）
链 B
24–303（280 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 1I51 CRYSTAL STRUCTURE OF CASPASE-7 COMPLEXED WITH XIAP 提交 2001-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
51–198（148 aa）
链 B
199–303（105 aa）
链 C
51–198（148 aa）
链 D
199–303（105 aa）
|
突变：D169A 突变：D169A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；ammonium sulfate, PEG4000, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.272 |
| 1K86 Crystal structure of caspase-7 提交 2001-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
51–303（253 aa）
链 B
51–303（253 aa）
|
突变：C186A 突变：C186A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；PEG 4000, sodium chloride, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.257 |
| 1K88 Crystal structure of procaspase-7 提交 2001-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
51–303（253 aa）
片段：procaspase-7
链 B
51–303（253 aa）
片段：procaspase-7
|
突变：C186A 突变：C186A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；296 K；lithium sulfate, sodium chloride, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.253 |
| 1KMC Crystal Structure of the Caspase-7 / XIAP-BIR2 Complex 提交 2001-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–303（303 aa）
链 B
1–303（303 aa）
|
突变：C285A 突变：C285A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.3；295 K；PEG 3000, Phosphate/citrate, NaCl, pH 4.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.275 |
| 1SHJ Caspase-7 in complex with DICA allosteric inhibitor 提交 2004-02-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
50–303（254 aa）
链 B
50–303（254 aa）
|
突变：D169A 突变：D169A | SO4 SULFATE ION × 3 NXN 2-(2,4-DICHLORO-PHENOXY)-N-(2-MERCAPTO-ETHYL)-ACETAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；citrate, LiSO4, NaCl, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.287 |
| 1SHL CASPASE-7 IN COMPLEX WITH FICA ALLOSTERIC INHIBITOR 提交 2004-02-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
57–199（143 aa）
链 A
210–303（94 aa）
链 B
57–199（143 aa）
链 B
210–303（94 aa）
|
突变：D192A 突变：D192A 突变：D192A 突变：D192A | FXN 5-FLUORO-1H-INDOLE-2-CARBOXYLIC ACID-(2-MERCAPTO-ETHYL)-AMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；citrate, lithium sulfate, sodium chloride, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 2QL5 Crystal Structure of caspase-7 with inhibitor AC-DMQD-CHO 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；14.5% PEG 3350, 0.3M diammonium hydrogen citrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.233 |
| 2QL7 Crystal Structure of Caspase-7 with inhibitor AC-IEPD-CHO 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；298 K；14.5% PEG 3350, 0.3M diammonium hydrogen citrate, 10mM DTT, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.237 |
| 2QL9 Crystal Structure of Caspase-7 with inhibitor AC-DQMD-CHO 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；298 K；14.5% PEG 3350, 0.3M diammonium hydrogen citrate, 10mM DTT, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.225 |
| 2QLB Crystal Structure of caspase-7 with inhibitor AC-ESMD-CHO 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；298 K；14.5% PEG 3350, 0.3M diammonium hydrogen citrate, 10mM DTT, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.223 |
| 2QLF Crystal Structure of Caspase-7 with inhibitor AC-DNLD-CHO 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；298 K；14.5% PEG 3350, 0.3M diammonium hydrogen citrate, 10mM DTT, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.229 |
| 2QLJ Crystal Structure of Caspase-7 with Inhibitor AC-WEHD-CHO 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；298 K；14.5% PEG 3350, 0.3M diammonium hydrogen citrate, 10mM DTT, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 3EDR The crystal structure of caspase-7 in complex with Acetyl-LDESD-CHO 提交 2008-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit (UNP residues 24 to 196)
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit (UNP residues 207 to 303)
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit (UNP residues 24 to 196)
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit (UNP residues 207 to 303)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2.1M Sodium Formate,0.1M Sodium Citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.248 |
| 3H1P Mature Caspase-7 I213A with DEVD-CHO inhibitor bound to active site 提交 2009-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
50–303（254 aa）
链 B
50–303（254 aa）
|
突变：I213A 突变：I213A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；14% PEG 3350, 300mM diammonium hydrogen citrate, 10mM guanidine hydrochloride, and 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.251 |
| 3IBC Crystal Structure of Caspase-7 incomplex with Acetyl-YVAD-CHO 提交 2009-07-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；14.5% PEG 3350, 0.3 M diammonium hydrogen citrate, 10mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.242 |
| 3IBF Crystal structure of unliganded caspase-7 提交 2009-07-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 B
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
链 C
24–196（173 aa）
片段：P20 subunit
链 D
207–303（97 aa）
片段：P10 subunit
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2.1M Sodium formate, 0.1M Sodium citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.235 |
| 3R5K A designed redox-controlled caspase-7 提交 2011-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–303（303 aa）
链 B
1–303（303 aa）
|
突变：R210C C246S 突变：R210C C246S | FMT FORMIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；2.1M Formate, 100mM Citrate, 1.25mM Cystamine, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.251 |
| 4FDL Crystal structure of Caspase-7 提交 2012-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
链 B
2–303（302 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.0-5.7, 1.9 M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.239 |
| 4FEA Crystal structure of CASPASE-7 in Complex with allosteric inhibitor 提交 2012-05-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
57–303（247 aa）
片段：P20/P10 catalytic domain (UNP residues 57-303)
链 B
57–303（247 aa）
片段：P20/P10 catalytic domain (UNP residues 57-303)
|
未记录 | 0TE chloro{methyl hydrogenato(3-)-kappa~2~N,S [pyridin-2-yl(pyridin-2(1H)-ylidene-kappaN)methyl]carbonodithiohydrazonate}copper × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.0-5.7, 1.9 M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.79 Å R-free 0.286 |
| 4HQ0 Crystal Structure of mutant form of Caspase-7 提交 2012-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
47–303（257 aa）
片段：UNP residues 47-303
链 B
47–303（257 aa）
片段：UNP residues 47-303
|
突变：D198A 突变：D198A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；sodium acetate pH 4.6, sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.267 |
| 4HQR Crystal Structure of mutant form of Caspase-7 提交 2012-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
47–303（257 aa）
片段：UNP residues 47-303
链 B
47–303（257 aa）
片段：UNP residues 47-303
|
突变：D198A 突变：D198A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；sodium formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.253 |
| 4JB8 Caspase-7 in Complex with DARPin C7_16 提交 2013-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
24–198（175 aa）
链 B
207–303（97 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；0.2M MgCl2, 100mM Tris, 9% PEG 1000, 9% PEG 8000, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.194 |
| 4JJ8 Caspase-3 specific unnatural amino acid peptides 提交 2013-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
57–303（247 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；0.15M Sodium citrate pH 4.0, 2.0 M Sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.216 |
| 4JJ8 Caspase-3 specific unnatural amino acid peptides 提交 2013-03-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
57–303（247 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；0.15M Sodium citrate pH 4.0, 2.0 M Sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.216 |
| 4JR1 Human procaspase-7 bound to Ac-DEVD-CMK 提交 2013-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
57–303（247 aa）
片段：protease domain (UNP residues 57-303)
链 B
57–303（247 aa）
片段：protease domain (UNP residues 57-303)
|
突变：D198A 突变：D198A | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；10 mM Tris, pH 8.0, 2 mM DTT, 50 mM sodium chloride, 200 mM ammonium formate, 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.227 |
| 4JR2 Human procaspase-7/caspase-7 heterodimer bound to Ac-DEVD-CMK 提交 2013-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
57–303（247 aa）
片段：protease domain (UNP residues 57-303)
链 B
57–303（247 aa）
片段：protease domain (UNP residues 57-303)
|
突变：D198A 突变：D198A | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10 mM Tris, pH 8.0, 2 mM DTT, 50 mM sodium chloride, 200 mM sodium/potassium phosphate, 100 mM Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.197 |
| 4LSZ Caspase-7 in Complex with DARPin D7.18 提交 2013-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
24–198（175 aa）
片段：Caspase-7 subunit p20, UNP residues 24-198
链 B
207–303（97 aa）
片段：Caspase-7 subunit p10, UNP residues 207-303
链 C
24–198（175 aa）
片段：Caspase-7 subunit p20, UNP residues 24-198
链 D
207–303（97 aa）
片段：Caspase-7 subunit p10, UNP residues 207-303
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293.15 K；0.8M Sodium Formate, 100mM Tris, 13% PEG 4000, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.208 |
| 4ZVO Caspase-7 Variant 4 (V4) with reprogrammed substrate specificity due to Y230V/W232Y/S234V/Q276D substitutions bound to VEID inhibitor. 提交 2015-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 B
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
链 C
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 D
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
|
突变：Y230V, W232Y, S234V, Q276D 突变：Y230V, W232Y, S234V, Q276D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；300 mM diammonium citrate, 14% PEG 3350, 10 mM GuHCl
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.251 |
| 4ZVP Caspase-7 Variant 2 (V2) with reprogrammed substrate specificity due to Y230V/W232M/Q276C substitutions bound to DEVD inhibitor. 提交 2015-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
34–231（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 B
232–336（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
链 C
34–231（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 D
232–336（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
|
突变：Y230V/W232M/Q276C 突变：Y230V/W232M/Q276C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；300 mM diammonium citrate, 14% PEG 3350, 10 mM GuHCl, 20% glycerol
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.224 |
| 4ZVQ Caspase-7 Variant 2 (V2) with reprogrammed substrate specificity due to Y230V/W232M/Q276C substitutions bound to VEID inhibitor. 提交 2015-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
34–231（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 B
232–336（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
链 C
34–231（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 D
232–336（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
|
突变：Y230V/W232M/Q276C 突变：Y230V/W232M/Q276C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；300 mM diammonium citrate, 14% PEG 3350, 10 mM GuHCl, 20% glycerol
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.208 |
| 4ZVR Caspase-7 Variant 4 (V4) with reprogrammed substrate specificity due to Y230V/W232Y/S234V/Q276D substitutions bound to DEVD inhibitor. 提交 2015-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 B
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
链 C
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 D
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
|
突变：Y230V,W232Y,S234V,Q276D 突变：Y230V,W232Y,S234V,Q276D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；300 mM diammonium citrate, 14% PEG 3350, 10 mM GuHCl, 20% glycerol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
| 4ZVS Caspase-7 Variant 1 (V1) with reprogrammed substrate specificity due to Y230A/W232M/S234N substitutions, bound to DEVD inhibitor. 提交 2015-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 B
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
链 C
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 D
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
|
突变：Y230A, W232M, S234N 突变：Y230A, W232M, S234N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277.15 K；300 mM Diammonium Hydrogren Citrate, 14% PEG 3350, 10 mM Guanidinium Chloride, 10 mM Dithiotheritol
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 4ZVT Caspase-7 Variant 1 (V1) with reprogrammed substrate specificity due to Y230A/W232M/S234N substitutions, bound to VEID inhibitor. 提交 2015-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 B
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
链 C
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 D
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
|
突变：Y230A, W232M, S234N 突变：Y230A, W232M, S234N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277.15 K；300 mM Diammonium Hydrogen Citrate, 14% PEG 3350, 10 mM Guanidinium Chloride, 10 mM Dithiotheritol
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.234 |
| 4ZVU Caspase-7 wild-type bound to the caspase-6 cognate tetrapeptide inhibitor Ac-VEID-cho 提交 2015-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 B
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
链 C
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 34-231
链 D
199–303（105 aa）
片段：UNP residues 232-336
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277.15 K；300 mM Diammonium Hydrogen Citrate, 14% PEG 3350, 10 mM Guanidinium Chloride, 10 mM Dithiotheritol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.252 |
| 5IC6 Crystal structure of caspase-7 DEVE peptide complex 提交 2016-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
链 B
199–303（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2 M ammonium fluoride, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 20% (w/v) PEG 10000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.241 |
| 5IC6 Crystal structure of caspase-7 DEVE peptide complex 提交 2016-02-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–198（198 aa）
链 D
199–303（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2 M ammonium fluoride, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 20% (w/v) PEG 10000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.241 |
| 5K20 Caspase-7 S239E Phosphomimetic 提交 2016-05-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
34–231（198 aa）
链 B
232–336（105 aa）
链 C
34–231（198 aa）
链 D
232–336（105 aa）
|
突变：S272E 突变：S272E | FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.1 M Sodium Formate
100 mM Sodium Citrate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.228 |
| 5V6U Crystal structure of human caspase-7 soaked with allosteric inhibitor 2-[(2-acetylphenyl)sulfanyl]benzoic acid 提交 2017-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
34–336（303 aa）
片段：UNP residues 34-336
链 B
34–336（303 aa）
片段：UNP residues 34-336
|
未记录 | 8YM 2-[(2-acetylphenyl)sulfanyl]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.9 M sodium formate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.7
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 5V6Z Crystal structure of human caspase-7 soaked with allosteric inhibitor 2-{[2-(4-chlorophenyl)-2-oxoethyl]sulfanyl}benzoic acid 提交 2017-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
34–336（303 aa）
片段：UNP residues 34-336
链 B
34–336（303 aa）
片段：UNP residues 34-336
|
未记录 | 8YJ 2-{[2-(4-chlorophenyl)-2-oxoethyl]sulfanyl}benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.9 M sodium formate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.0-5.7
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.249 |
| 6CL1 Caspase-7 in complex with Ac-DW3-KE 提交 2018-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
34–231（198 aa）
链 B
232–336（105 aa）
链 C
34–231（198 aa）
链 D
232–336（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；1:1 dilution with 0.15 M sodium citrate, 1.6 M sodium formate, pH 5.0
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.243 |
| 6CL2 Caspase-7 in complex with Ac-ATS009-KE 提交 2018-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
34–231（198 aa）
链 B
232–336（105 aa）
链 C
34–231（198 aa）
链 D
232–336（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；1:1 dilution with 0.15 M sodium citrate, 1.6 M sodium formate, pH 5.0.
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 6X8J Caspase-7 in complex with ketomethylene inhibitor reveals tetrahedral adduct 提交 2020-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
34–231（198 aa）
片段：p20 (UNP residues 34-231)
链 B
34–231（198 aa）
片段：p20 (UNP residues 34-231)
链 C
232–336（105 aa）
片段：p11 (UNP residues 232-336)
链 D
232–336（105 aa）
片段：p11 (UNP residues 232-336)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；295 K；1:1 protein : 0.15 M sodium citrate, 1.4 M sodium formate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.211 |
| 6X8L Caspase-7 in complex with elongated ketomethylene inhibitor 提交 2020-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
34–231（198 aa）
片段：p20 (UNP residues 34-231)
链 B
34–231（198 aa）
片段：p20 (UNP residues 34-231)
链 C
232–336（105 aa）
片段：p11 (UNP residues 232-336)
链 D
232–336（105 aa）
片段：p11 (UNP residues 232-336)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；1:1 protein : 0.15 M sodium citrate, 1.45 M sodium formate
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.215 |
| 7WZS Crystal structure of Chromobacterium violaceum effector CopC in complex with host calmodulin and caspase-7 提交 2022-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
24–303（280 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM Bis-Tris propane pH 7.5, 1.5 M lithium sulfate
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.314 |
| 8DGZ Caspase-7 bound to substrate mimic and allosteric inhibitor 提交 2022-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
链 B
2–303（302 aa）
|
未记录 | 8YJ 2-{[2-(4-chlorophenyl)-2-oxoethyl]sulfanyl}benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M sodium citrate and 2.1 M sodium formate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 8DJ3 Caspase-7 bound to novel allosteric inhibitor 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
链 B
2–303（302 aa）
|
未记录 | SE1 2-[(2-{[(3s,5s,7s)-adamantan-1-yl]sulfamoyl}phenyl)sulfanyl]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.9 M sodium formate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.0-5.7
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.249 |