当前蛋白身份:P56282
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2V6Z Solution Structure of Amino-Terminal Domain of Human DNA Polymerase Epsilon Subunit B 提交 2007-07-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 M
1–75(75 aa)
片段:AMINO TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-75
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.62;298 K;压力 1.0
NMR样品组成
0.7 MM PROTEIN
NMR样品组成
155 MM NACL
NMR样品组成
25 MM TRIS-HCL
NMR样品组成
25 MM IMIDAZOLE
NMR样品组成
1.25 MM EDTA
NMR样品组成
93% H2O, 7% D2O
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分辨率未提供 |
| 5VBN Crystal Structure of human DNA polymerase epsilon B-subunit in complex with C-terminal domain of catalytic subunit 提交 2017-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–527(527 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;50 mM sodium citrate, pH5.6, 0.70 M ammonium sulfate and 2 mM TCEP
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.264 |
| 5VBN Crystal Structure of human DNA polymerase epsilon B-subunit in complex with C-terminal domain of catalytic subunit 提交 2017-03-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
1–527(527 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;50 mM sodium citrate, pH5.6, 0.70 M ammonium sulfate and 2 mM TCEP
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.264 |
| 7PFO Core human replisome 提交 2021-08-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–527(527 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 7PLO H. sapiens replisome-CUL2/LRR1 complex 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:26-meric(26) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–527(527 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å |