当前蛋白身份：P56537
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6LQM Cryo-EM structure of a pre-60S ribosomal subunit - state C 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 251 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 6LSR Cryo-EM structure of a pre-60S ribosomal subunit - state B 提交 2020-01-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 246 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 6LSS Cryo-EM structure of a pre-60S ribosomal subunit - state preA 提交 2020-01-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 250 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 6LU8 Cryo-EM structure of a human pre-60S ribosomal subunit - state A 提交 2020-01-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 247 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 7OW7 EIF6-bound large subunit of the human ribosome 提交 2021-06-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric（43） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 223 ZN ZINC ION × 5 K POTASSIUM ION × 153 NA SODIUM ION × 4 BR BROMIDE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8A3D Human mature large subunit of the ribosome with eIF6 and homoharringtonine bound 提交 2022-06-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric（45） 与全部聚合物一致 |
链 h
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 229 K POTASSIUM ION × 155 NA SODIUM ION × 2 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 SPM SPERMINE × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；30 seconds 'wait' time
|
分辨率 1.67 Å |
| 8FKP Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State A1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.85 Å |
| 8FKQ Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State A2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric（43） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 51 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.76 Å |
| 8FKR Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State B1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.89 Å |
| 8FKS Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State B2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 61 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.88 Å |
| 8FKT Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State C1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 64 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.81 Å |
| 8FKU Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State C2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 58 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.82 Å |
| 8FKV Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State D1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 65 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.47 Å |
| 8FKW Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State D2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 59 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.50 Å |
| 8FKX Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State E) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 61 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.59 Å |
| 8FKY Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State F) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 70 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.67 Å |
| 8FKZ Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State G) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 64 ZN ZINC ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 3.04 Å |
| 8FL0 Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State H) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 22 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.91 Å |
| 8FL2 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 100 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.67 Å |
| 8FL3 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 100 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.53 Å |
| 8FL4 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I3) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：62-meric（62） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 99 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.89 Å |
| 8FL6 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.62 Å |
| 8FL7 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.55 Å |
| 8FL9 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J3) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.75 Å |
| 8FLA Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.63 Å |
| 8FLB Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.55 Å |
| 8FLC Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K3) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.76 Å |
| 8FLD Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L1) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.58 Å |
| 8FLE Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L2) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.48 Å |
| 8FLF Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L3) 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 SK
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.65 Å |
| 8IDT human nuclear pre-60S ribosomal particle - State G 提交 2023-02-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8IDY human nuclear pre-60S ribosomal particle - State F 提交 2023-02-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8IE3 human nuclear pre-60S ribosomal particle - State E 提交 2023-02-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8INE human nuclear pre-60S ribosomal particle - State G' 提交 2023-03-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8INF human nuclear pre-60S ribosomal particle - State F' 提交 2023-03-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric（61） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8INK human nuclear pre-60S ribosomal particle - State D 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8IPD human nuclear pre-60S ribosomal particle - State C 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8IPX human nuclear pre-60S ribosomal particle - State C' 提交 2023-03-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8IPY human nuclear pre-60S ribosomal particle - State D' 提交 2023-03-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8IR1 human nuclear pre-60S ribosomal particle - State A 提交 2023-03-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8IR3 human nuclear pre-60S ribosomal particle - State B' 提交 2023-03-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–245（245 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8OHD 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 3 (native) 提交 2023-03-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8OJ0 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 2 (native) 提交 2023-03-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8OJ8 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 1 (native) 提交 2023-03-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8RL2 Human pre-60S - State 5 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 CA
1–245（245 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 9GMO eIF6-bound pre-60S large ribosomal subunit incorporating mutant uL16 提交 2024-08-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric（46） 与全部聚合物一致 |
链 h
1–245（245 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 227 K POTASSIUM ION × 155 NA SODIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9P9K In situ human 60S ribosome with EIF6 提交 2025-06-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric（45） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–225（225 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 9QIW Human pre-60S - State 3 提交 2025-03-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 CA
1–245（245 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.04 Å |