当前蛋白身份:P58004
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5CUF X-ray crystal structure of SeMet human Sestrin2 提交 2015-07-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–480(480 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES
1.15 M sodium malonate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.272 |
| 5CUF X-ray crystal structure of SeMet human Sestrin2 提交 2015-07-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–480(480 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES
1.15 M sodium malonate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.272 |
| 5CUF X-ray crystal structure of SeMet human Sestrin2 提交 2015-07-24 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–480(480 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES
1.15 M sodium malonate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.272 |
| 5CUF X-ray crystal structure of SeMet human Sestrin2 提交 2015-07-24 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
1–480(480 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES
1.15 M sodium malonate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.272 |
| 5CUF X-ray crystal structure of SeMet human Sestrin2 提交 2015-07-24 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 E
1–480(480 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES
1.15 M sodium malonate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.272 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 E
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5DJ4 Leucine-bound Sestrin2 from Homo sapiens 提交 2015-09-01 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
1–480(480 aa)
链 D
1–480(480 aa)
链 E
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;1.2 M disodium malonate, 0.1 M MES pH 6.0, 1% (v/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5T0N Pseudo-apo structure of Sestrin2 at 3.0 angstrom resolution 提交 2016-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291.15 K;0.1 M MES pH 6.0, 1.2 M sodium malonate, 1% (w/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.225 |
| 5T0N Pseudo-apo structure of Sestrin2 at 3.0 angstrom resolution 提交 2016-08-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291.15 K;0.1 M MES pH 6.0, 1.2 M sodium malonate, 1% (w/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.225 |
| 5T0N Pseudo-apo structure of Sestrin2 at 3.0 angstrom resolution 提交 2016-08-16 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291.15 K;0.1 M MES pH 6.0, 1.2 M sodium malonate, 1% (w/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.225 |
| 5T0N Pseudo-apo structure of Sestrin2 at 3.0 angstrom resolution 提交 2016-08-16 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291.15 K;0.1 M MES pH 6.0, 1.2 M sodium malonate, 1% (w/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.225 |
| 5T0N Pseudo-apo structure of Sestrin2 at 3.0 angstrom resolution 提交 2016-08-16 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 E
1–480(480 aa)
|
未记录 | LEU LEUCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291.15 K;0.1 M MES pH 6.0, 1.2 M sodium malonate, 1% (w/v) Jeffamine ED 2001
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.225 |
| 6N0M CRYSTAL STRUCTURE OF SESTRIN2 IN COMPLEX WITH NV-0005138 提交 2018-11-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
66–480(415 aa)
|
未记录 | K94 4-(difluoromethyl)-L-leucine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;1.35M Na malonate pH 6.5, 0.1M Mes pH 6.0
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.250 |
| 6N0M CRYSTAL STRUCTURE OF SESTRIN2 IN COMPLEX WITH NV-0005138 提交 2018-11-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
66–480(415 aa)
|
未记录 | K94 4-(difluoromethyl)-L-leucine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;1.35M Na malonate pH 6.5, 0.1M Mes pH 6.0
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.250 |
| 6N0M CRYSTAL STRUCTURE OF SESTRIN2 IN COMPLEX WITH NV-0005138 提交 2018-11-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
66–480(415 aa)
|
未记录 | K94 4-(difluoromethyl)-L-leucine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;1.35M Na malonate pH 6.5, 0.1M Mes pH 6.0
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.250 |
| 6N0M CRYSTAL STRUCTURE OF SESTRIN2 IN COMPLEX WITH NV-0005138 提交 2018-11-07 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
66–480(415 aa)
|
未记录 | K94 4-(difluoromethyl)-L-leucine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;1.35M Na malonate pH 6.5, 0.1M Mes pH 6.0
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.250 |
| 6N0M CRYSTAL STRUCTURE OF SESTRIN2 IN COMPLEX WITH NV-0005138 提交 2018-11-07 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 E
66–480(415 aa)
|
未记录 | K94 4-(difluoromethyl)-L-leucine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;1.35M Na malonate pH 6.5, 0.1M Mes pH 6.0
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.250 |
| 9LVJ Cryo-EM structure of Sestrin2 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 U
1–480(480 aa)
链 V
1–480(480 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 9LWF Cryo-EM structure of dual sensor bound GATOR2 complex 提交 2025-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致 |
链 X
1–480(480 aa)
链 Y
1–480(480 aa)
|
突变:Y375F 突变:Y375F | ZN ZINC ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |