当前蛋白身份：P60338
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AIP EF-TU EF-TS COMPLEX FROM THERMUS THERMOPHILUS 提交 1997-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–405（405 aa）
链 B
1–405（405 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；60 MM CACODYLATE, PH 6.5 70 MM AMMONIUM SULFATE 8% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.289 |
| 1AIP EF-TU EF-TS COMPLEX FROM THERMUS THERMOPHILUS 提交 1997-04-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–405（405 aa）
链 F
1–405（405 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；60 MM CACODYLATE, PH 6.5 70 MM AMMONIUM SULFATE 8% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.289 |
| 1EXM CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ELONGATION FACTOR TU (EF-TU) IN COMPLEX WITH THE GTP ANALOGUE GPPNHP. 提交 2000-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–406（405 aa）
片段：INTACT WILD-TYPE EF-TU
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20mM Sodium cacodylate, 5mM Magnesium sulfate, 38-44% Ammonium sulfate, 7-10 mg/mL EF-Tu, molar ratio EF-Tu:GppNHp =
1:5, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 1.70 Å R-free 0.243 |
| 4H9G Probing EF-Tu with a very small brominated fragment library identifies the CCA pocket 提交 2012-09-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–406（405 aa）
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未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 14J 5-bromofuran-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
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分辨率 1.93 Å R-free 0.184 |
| 4LBV Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
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未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.193 |
| 4LBV Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
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未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.193 |
| 4LBW Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
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未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.194 |
| 4LBW Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.194 |
| 4LBY Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.207 |
| 4LBZ Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
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未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.212 |
| 4LBZ Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.212 |
| 4LC0 Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.201 |
| 4LC0 Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–406（404 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.201 |