当前蛋白身份：P61024
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BUH CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN CDK2 KINASE COMPLEX WITH CELL CYCLE-REGULATORY PROTEIN CKSHS1 提交 1998-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；17-19% MEPEG 5K, 100 MM TRIS-HCL PH 7.5, 100 MM KCL
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.250 |
| 1DKS CKSHS1: HUMAN CYCLIN DEPENDENT KINASE SUBUNIT, TYPE 1 IN COMPLEX WITH PHOSPHATE 提交 1995-11-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–79（79 aa）
链 B
1–79（79 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.290 |
| 1DKT CKSHS1: HUMAN CYCLIN DEPENDENT KINASE SUBUNIT, TYPE 1 COMPLEX WITH METAVANADATE 提交 1995-11-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–79（79 aa）
链 B
1–79（79 aa）
|
未记录 | V7O META VANADATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å R-free 0.258 |
| 2ASS Crystal structure of the Skp1-Skp2-Cks1 complex 提交 2005-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
5–73（69 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 BEN BENZAMIDINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；BTP, sodium/potassium phosphate, benzamidine, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.242 |
| 2ASS Crystal structure of the Skp1-Skp2-Cks1 complex 提交 2005-08-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
5–73（69 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 6 BEN BENZAMIDINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；BTP, sodium/potassium phosphate, benzamidine, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.242 |
| 2ASS Crystal structure of the Skp1-Skp2-Cks1 complex 提交 2005-08-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
5–73（69 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 6 BEN BENZAMIDINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；BTP, sodium/potassium phosphate, benzamidine, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.242 |
| 2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
5–73（69 aa）
|
未记录 | BEN BENZAMIDINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
5–73（69 aa）
|
未记录 | BEN BENZAMIDINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
5–73（69 aa）
|
未记录 | BEN BENZAMIDINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 4YC6 CDK1/CKS1 提交 2015-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.3；277 K；16-18% PEG 10 000, 0.1M imidazole pH 8.2 -8.4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 4YC6 CDK1/CKS1 提交 2015-02-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.3；277 K；16-18% PEG 10 000, 0.1M imidazole pH 8.2 -8.4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 4YC6 CDK1/CKS1 提交 2015-02-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.3；277 K；16-18% PEG 10 000, 0.1M imidazole pH 8.2 -8.4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 4YC6 CDK1/CKS1 提交 2015-02-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.3；277 K；16-18% PEG 10 000, 0.1M imidazole pH 8.2 -8.4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 7B5L Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27-UBE2L3~Ub~ARIH1. Transition State 1 提交 2020-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–73（73 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7B5M Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-p27~Ub~ARIH1. Transition State 2 提交 2020-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 K
1–79（79 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 7B5R Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27 提交 2020-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 K
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7NJ0 CryoEM structure of the human Separase-Cdk1-cyclin B1-Cks1 complex 提交 2021-02-14 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–79（79 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8BYA Cryo-EM structure of SKP1-SKP2-CKS1-CDK2-CyclinA-p27KIP1 Complex 提交 2022-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 8BYL Cryo-EM structure of SKP1-SKP2-CKS1 from the SCFSKP2 E3 ligase complex 提交 2022-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–79（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8OR0 CAND1-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKS1-CDK2 提交 2023-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 G
1–73（73 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8OR4 Partially dissociated CAND1-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKS1-CDK2 提交 2023-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 G
5–73（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9QO0 Pre-activated 9-subunit COP9 signalosome and neddylated SCF (Skp1-Skp2-Cks1) complex structure 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric（15） 与蛋白数一致 |
链 N
1–79（79 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9QO2 Dissociation-state-1 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 N
1–79（79 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9QO3 Dissociation-state-2 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 N
1–79（79 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 9QO4 Dissociation-state-3 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 N
1–79（79 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9QO5 Dissociation-state-4 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 N
1–79（79 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |