当前蛋白身份：P61224
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3BRW Structure of the Rap-RapGAP complex 提交 2007-12-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-167
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；285 K；8-11% PEG 2000 MME, 100mM MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.280 |
| 3CF6 Structure of Epac2 in complex with cyclic-AMP and Rap 提交 2008-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-167
|
未记录 | SP1 6-(6-AMINO-PURIN-9-YL)-2-THIOXO-TETRAHYDRO-2-FURO[3,2-D][1,3,2]DIOXAPHOSPHININE-2,7-DIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M Li2SO4, 0.1M citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.265 |
| 3CF6 Structure of Epac2 in complex with cyclic-AMP and Rap 提交 2008-03-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-167
|
未记录 | SP1 6-(6-AMINO-PURIN-9-YL)-2-THIOXO-TETRAHYDRO-2-FURO[3,2-D][1,3,2]DIOXAPHOSPHININE-2,7-DIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M Li2SO4, 0.1M citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.265 |
| 4DXA Co-crystal structure of Rap1 in complex with KRIT1 提交 2012-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–167（167 aa）
|
突变：G12V | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M KNO3, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.239 |
| 4HDO Crystal structure of the binary Complex of KRIT1 bound to the Rap1 GTPase 提交 2012-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-167
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；15% PEG2000 MME, 100 mM Tris, 100 mM potassium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.231 |
| 4HDQ Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and the Heart of Glass (HEG1) cytoplasmic tail 提交 2012-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-167
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；15% PEG2000 MME, 100 mM Tris, 100 mM potassium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.263 |
| 4M8N Crystal Structure of PlexinC1/Rap1B Complex 提交 2013-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–166（166 aa）
链 H
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294.15 K；0.1 M HEPES, 5% 2-propanol, 25% PEG 3350, 3.6% polypropylene glycol P400, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.15K
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.299 |
| 4M8N Crystal Structure of PlexinC1/Rap1B Complex 提交 2013-08-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
1–166（166 aa）
链 G
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294.15 K；0.1 M HEPES, 5% 2-propanol, 25% PEG 3350, 3.6% polypropylene glycol P400, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.15K
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.299 |
| 4MGI Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 4MGI Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 4MGK Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.264 |
| 4MGK Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.264 |
| 4MGY Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | H07 (2S,4aR,6R,7R,7aR)-6-{6-amino-8-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]-9H-purin-9-yl}-7-methoxytetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-2-ol 2-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.270 |
| 4MGY Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | H07 (2S,4aR,6R,7R,7aR)-6-{6-amino-8-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]-9H-purin-9-yl}-7-methoxytetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-2-ol 2-oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.270 |
| 4MGZ Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | HR6 (2S,4aR,6R,7R,7aS)-6-[6-amino-8-(benzylsulfanyl)-9H-purin-9-yl]-2-sulfanyltetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-7-ol 2-oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.264 |
| 4MGZ Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | HR6 (2S,4aR,6R,7R,7aS)-6-[6-amino-8-(benzylsulfanyl)-9H-purin-9-yl]-2-sulfanyltetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-7-ol 2-oxide × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.264 |
| 4MH0 Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | HR4 (2S,4aR,6R,7R,7aS)-6-{6-amino-8-[(4-fluorobenzyl)sulfanyl]-9H-purin-9-yl}-2-sulfanyltetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-7-ol 2-oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.282 |
| 4MH0 Selective activation of Epac1 and Epac2 提交 2013-08-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
1–167（167 aa）
片段：UNP residues 1-169
|
未记录 | HR4 (2S,4aR,6R,7R,7aS)-6-{6-amino-8-[(4-fluorobenzyl)sulfanyl]-9H-purin-9-yl}-2-sulfanyltetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-7-ol 2-oxide × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.4M (NH4)2SO4, 1.2M LI2SO4, 0.1M CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.282 |
| 5KHO Rasip1 RA domain in complex with Rap1B 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–167（167 aa）
链 D
1–167（167 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；16% PEG 8K, 200mM Calcium Acetate, and 100mM MES pH 6.5
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.286 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
1–167（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6BA6 Solution structure of Rap1b/talin complex 提交 2017-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
|
突变：G12V | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.6；301 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl, 5mM MgCl2；压力 101325
NMR测量条件
pH 6.6；301 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl, 5mM MgCl2；压力 101325
NMR样品组成
0.6 mM [U-13C; U-15N] Rap1b, 0.9 mM talin-F0, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] talin-F0, 0.7 mM Rap1b, 95% H20, 5% D2O | 95% H20, 5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-15N; U-2H] talin-F0, 0.7 mM Rap1b, 95% H20, 5% D2O | 95% H20, 5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] talin-F0, 0.7 mM Rap1b, 0.2% H20, 99.8% D20 | 0.2% H20, 99.8% D20
NMR样品组成
0.6 mM [U-13C; U-15N] Rap1b, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6KYK Crystal structure of Shank3 NTD-ANK mutant in complex with Rap1 提交 2019-09-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–167（167 aa）
链 D
1–167（167 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；289 K；0.1M bicine (pH8.5), 1% Dextran sulfate sodium salt, 5% PEG 20000, 10% PEG 1500
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.300 |
| 6KYK Crystal structure of Shank3 NTD-ANK mutant in complex with Rap1 提交 2019-09-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
1–167（167 aa）
链 F
1–167（167 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；289 K；0.1M bicine (pH8.5), 1% Dextran sulfate sodium salt, 5% PEG 20000, 10% PEG 1500
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.300 |
| 6OQ3 Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and HKi2 提交 2019-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
|
未记录 | 7WO 2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20-25% PEG 3,350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.292 |
| 6OQ4 Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and HKi1 提交 2019-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
|
未记录 | N0G 2-{(Z)-[(2-hydroxynaphthalen-1-yl)methylidene]amino}-N-[(1S)-1-phenylethyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20-25% PEG 3,350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.264 |
| 6UZK Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and HKi6 提交 2019-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
|
未记录 | QMA 2-hydroxy-6-methoxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20-25% PEG 3,350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.286 |
| 7C7I Crystal structure of SHANK3 SPN domain in complex with GTP-bound Rap1b(E30D,K31E) 提交 2020-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–167（167 aa）
链 B
1–167（167 aa）
|
突变：E30D,K31E 突变：E30D,K31E | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；14.4% (w/v) PEG 8000, Sodium cacodylate/Hydrochloric acid (pH 6.5), 160 mM Calcium acetate, 20% (v/v) Glycerol
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.246 |
| 7C7J Crystal structure of SHANK3 SPN domain in complex with GTP-bound Rap1b(G12V,Q63E) 提交 2020-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–167（167 aa）
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突变：G12V,Q63E | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10% (w/v) PEG 8000, 100 mM Imidazole/Hydrochloric acid (pH 8.0), 200 mM Calcium acetate
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.255 |
| 7C7J Crystal structure of SHANK3 SPN domain in complex with GTP-bound Rap1b(G12V,Q63E) 提交 2020-05-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
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突变：G12V,Q63E | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10% (w/v) PEG 8000, 100 mM Imidazole/Hydrochloric acid (pH 8.0), 200 mM Calcium acetate
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.255 |
| 8SU8 Co-crystal structure of KRIT1 with a 1-hydroxy 2-naphthaldehyde derivative (6-(furan-2-yl)-2-hydroxy-1-naphthaldehyde). 提交 2023-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
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未记录 | XE2 (6P)-6-(furan-2-yl)-2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.238 |
| 8T09 Co-crystal structure of KRIT1 with a 1-hydroxy 2-naphthaldehyde derivative (6-ethynyl-2-hydroxy-1-naphthaldehyde) 提交 2023-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
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未记录 | XHZ 6-ethynyl-2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 100mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl
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分辨率 2.15 Å R-free 0.247 |
| 8T7V Co-crystal structure of KRIT1 with a 1-hydroxy 2-naphthaldehyde derivative (6-(furan-2-yl)-2-hydroxy-1-naphthaldehyde) 提交 2023-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
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未记录 | ZTA (7M)-7-(furan-2-yl)-2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG 3350, 100mM Tris, pH 8.5, 100mM KCl
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分辨率 2.25 Å R-free 0.250 |