当前蛋白身份:P61978
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1J5K COMPLEX OF THE KH3 DOMAIN OF HNRNP K WITH A SINGLE_STRANDED 10MER DNA OLIGONUCLEOTIDE 提交 2002-05-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:dimeric(2) 与全部聚合物一致 |
链 A
379–463(85 aa)
片段:KH3 domain, RESIDUES 379-463, NUMBERED 5-89
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM SODIUM PHOSPHATE
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分辨率未提供 |
| 1KHM C-TERMINAL KH DOMAIN OF HNRNP K (KH3) 提交 1999-01-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
375–463(89 aa)
片段:C-TERMINAL KH DOMAIN, RESIDUES 379-463 OF FULL LENGTH HNRNP K
|
突变:G26R | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)5 mM;压力 1
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分辨率未提供 |
| 1ZZI Crystal Structure Analysis of the third KH domain of hnRNP K in complex with ssDNA 提交 2005-06-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:dimeric(2) 与全部聚合物一致 |
链 A
385–463(79 aa)
片段:KH3 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;294 K;PEG 4000, TRIS HCl, MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.240 |
| 1ZZI Crystal Structure Analysis of the third KH domain of hnRNP K in complex with ssDNA 提交 2005-06-14 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:dimeric(2) 与全部聚合物一致 |
链 B
385–463(79 aa)
片段:KH3 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;294 K;PEG 4000, TRIS HCl, MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.240 |
| 1ZZJ Structure of the third KH domain of hnRNP K in complex with 15-mer ssDNA 提交 2005-06-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
385–463(79 aa)
片段:KH3 domain
链 B
385–463(79 aa)
片段:KH3 domain
链 C
385–463(79 aa)
片段:KH3 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;PEG 8000, SODIUM ACETATE, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.283 |
| 1ZZK Crystal Structure of the third KH domain of hnRNP K at 0.95A resolution 提交 2005-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
385–463(79 aa)
片段:KH3 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;294 K;ammonium sulphate, PEG 400, Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 0.95 Å R-free 0.127 |
| 7CRU hnRNPK NLS in complex with Importin alpha 1 (KPNA2) 提交 2020-08-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
18–38(21 aa)
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未记录 | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.240 |
| 7CRU hnRNPK NLS in complex with Importin alpha 1 (KPNA2) 提交 2020-08-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
18–38(21 aa)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.240 |
| 7RJK Crystal structure of human Bromodomain containing protein 3 (BRD3) in complex with hnRNPK 提交 2021-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
57–66(10 aa)
片段:UNP residues 57-66
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.2 M potassium/sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.217 |
| 7RJK Crystal structure of human Bromodomain containing protein 3 (BRD3) in complex with hnRNPK 提交 2021-07-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
57–66(10 aa)
片段:UNP residues 57-66
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.2 M potassium/sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.217 |
| 7RJO Crystal structure of human Bromodomain containing protein 4 (BRD4) in complex with hnRNPK 提交 2021-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
57–66(10 aa)
片段:UNP residues 57-66
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;25% w/v PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris
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分辨率 1.38 Å R-free 0.198 |