当前蛋白身份：P62812
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5OSA GLIC-GABAAR alpha1 chimera crystallized at pH4.6 提交 2017-08-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
250–338（89 aa）
链 A
417–455（39 aa）
链 B
250–338（89 aa）
链 B
417–455（39 aa）
链 C
250–338（89 aa）
链 C
417–455（39 aa）
链 D
250–338（89 aa）
链 D
417–455（39 aa）
链 E
250–338（89 aa）
链 E
417–455（39 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 7 D12 DODECANE × 8 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；289.15 K；100 mM NaCl, 100 mM sodium acetate pH 4.6, 12 % PEG 6000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.229 |
| 5OSB GLIC-GABAAR alpha1 chimera crystallized in complex with THDOC at pH4.5 提交 2017-08-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
250–338（89 aa）
链 A
417–455（39 aa）
链 B
250–338（89 aa）
链 B
417–455（39 aa）
链 C
250–338（89 aa）
链 C
417–455（39 aa）
链 D
250–338（89 aa）
链 D
417–455（39 aa）
链 E
250–338（89 aa）
链 E
417–455（39 aa）
|
未记录 | A8Z Tetrahydrodeoxycorticosterone × 5 ACT ACETATE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；289 K；12-16% PEG4000, 100mM NaCl, 100 mM Li2SO4, 100mM sodium acetate pH4-4.5
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.290 |
| 5OSC GLIC-GABAAR alpha1 chimera crystallized in complex with pregnenolone sulfate at pH 4.5 提交 2017-08-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
417–455（39 aa）
链 B
417–455（39 aa）
链 C
417–455（39 aa）
链 D
417–455（39 aa）
链 E
417–455（39 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 5 A8W Pregnenolone sulfate × 5 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；289 K；12-16% PEG 4000, 100 mM NaCl, 100 mM Li2S04, 100 mM sodium acetate pH 4-5
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.246 |
| 8FOI Native GABA-A receptor from the mouse brain, alpha1-beta2-gamma2 subtype, in complex with GABA and allopregnanolone 提交 2022-12-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–455（455 aa）
链 C
1–455（455 aa）
|
未记录 | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 2 D12 DODECANE × 17 OCT N-OCTANE × 17 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 Y4B allopregnanolone × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 8G4N Native GABA-A receptor from the mouse brain, alpha1-beta2-gamma2 subtype, in complex with GABA, Zolpidem, and endogenous neurosteroids 提交 2023-02-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–455（455 aa）
链 C
1–455（455 aa）
|
未记录 | Y4B allopregnanolone × 2 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 2 D12 DODECANE × 17 OCT N-OCTANE × 17 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 R5R Zolpidem × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |
| 8G4O Native GABA-A receptor from the mouse brain, alpha1-beta2-gamma2 subtype, in complex with didesethylflurazepam and endogenous GABA 提交 2023-02-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–455（455 aa）
链 C
1–455（455 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 YNL (5M)-1-(2-aminoethyl)-7-chloro-5-(2-fluorophenyl)-1,3-dihydro-2H-1,4-benzodiazepin-2-one × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 8G4X Native GABA-A receptor from the mouse brain, meta-alpha1-alpha3-beta2-gamma2 subtype, in complex with GABA and allopregnanolone 提交 2023-02-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–455（455 aa）
|
未记录 | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 2 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y4B allopregnanolone × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.56 Å |
| 8G5F Native GABA-A receptor from the mouse brain, ortho-alpha1-alpha3-beta2-gamma2 subtype, in complex with GABA and allopregnanolone 提交 2023-02-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
1–455（455 aa）
|
未记录 | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 2 Y4B allopregnanolone × 2 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 8G5G Native GABA-A receptor from the mouse brain, meta-alpha1-alpha3-beta2-gamma2 subtype, in complex with GABA, Zolpidem, and endogenous neurosteroid 提交 2023-02-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–455（455 aa）
|
未记录 | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 2 Y4B allopregnanolone × 1 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 R5R Zolpidem × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 8G5H Native GABA-A receptor from the mouse brain, ortho-alpha1-alpha3-beta2-gamma2 subtype, in complex with GABA, Zolpidem, and endogenous neurosteroid 提交 2023-02-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
1–455（455 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 2 R5R Zolpidem × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y4B allopregnanolone × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |