当前蛋白身份：P62894
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2B4Z Crystal structure of cytochrome C from bovine heart at 1.5 A resolution. 提交 2005-09-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–104（104 aa）
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未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROSEEDING；pH 7；277 K；PEG 1000, SODIUM PHOSPHATE, pH 7.0, MICROSEEDING, temperature 277K
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分辨率 1.50 Å R-free 0.218 |
| 2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 Y
2–105（104 aa）
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未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
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分辨率 19.00 Å |
| 3J2T An improved model of the human apoptosome 提交 2012-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 H
2–105（104 aa）
链 I
2–105（104 aa）
链 J
2–105（104 aa）
链 K
2–105（104 aa）
链 L
2–105（104 aa）
链 M
2–105（104 aa）
链 N
2–105（104 aa）
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
low salt HEPES buffer；pH 7.5；20mM HEPES, 10mM KCl, 1.5mM MgCl2, 1mM EDTA, 1mM EGTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 2 seconds before plunging；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging (FEI VITROBOT MARK III)
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分辨率 9.50 Å |
| 5JUY Active human apoptosome with procaspase-9 提交 2016-05-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 H
2–105（104 aa）
链 I
2–105（104 aa）
链 J
2–105（104 aa）
链 K
2–105（104 aa）
链 L
2–105（104 aa）
链 M
2–105（104 aa）
链 N
2–105（104 aa）
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未记录 | DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 7 HEC HEME C × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Buffer A
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.10 Å |
| 6FF5 X-ray structure of bovine heart cytochrome c at high ionic strength 提交 2018-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–105（104 aa）
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未记录 | HEC HEME C × 1 NO3 NITRATE ION × 5 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；3.2-3.4 M ammonium sulfate and 0.4-0.5 M NaNO3
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分辨率 1.74 Å R-free 0.203 |