当前蛋白身份:P68433
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1U35 Crystal structure of the nucleosome core particle containing the histone domain of macroH2A 提交 2004-07-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致 |
链 A
0–135(136 aa)
链 E
0–135(136 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;292 K;potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.260 |
| 2XL3 WDR5 IN COMPLEX WITH AN RBBP5 PEPTIDE AND HISTONE H3 PEPTIDE 提交 2010-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
2–9(8 aa)
片段:AMINO TERMINAL TAIL, RESIDUES 2-9
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;0.2M K2SO4 20 % PEG 3350, pH 8.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.235 |
| 2XL3 WDR5 IN COMPLEX WITH AN RBBP5 PEPTIDE AND HISTONE H3 PEPTIDE 提交 2010-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
2–9(8 aa)
片段:AMINO TERMINAL TAIL, RESIDUES 2-9
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;0.2M K2SO4 20 % PEG 3350, pH 8.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.235 |
| 5B1M The mouse nucleosome structure containing H3.1 提交 2015-12-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–136(136 aa)
链 E
1–136(136 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.259 |
| 5IX1 Crystal structure of mouse Morc3 ATPase-CW cassette in complex with AMPPNP and H3K4me3 peptide 提交 2016-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 P
2–16(15 aa)
链 Q
2–16(15 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;5% ethanol, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M HEPES-Na
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.230 |
| 5IX2 Crystal structure of mouse Morc3 ATPase-CW cassette in complex with AMPPNP and unmodified H3 peptide 提交 2016-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 P
2–33(32 aa)
链 Q
2–33(32 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;5% ethanol, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M HEPES-Na
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.236 |
| 7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 E
14–32(19 aa)
链 F
14–32(19 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;1.2M Sodium malonate
0.1M MES pH 5.5
0.2M NaCl
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.255 |
| 7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 G
14–32(19 aa)
链 H
14–32(19 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;1.2M Sodium malonate
0.1M MES pH 5.5
0.2M NaCl
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.255 |