当前蛋白身份:P68433 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1U35 Crystal structure of the nucleosome core particle containing the histone domain of macroH2A 提交 2004-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 A 0–135(136 aa)
链 E 0–135(136 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;292 K;potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.00 Å R-free 0.260
2XL3 WDR5 IN COMPLEX WITH AN RBBP5 PEPTIDE AND HISTONE H3 PEPTIDE 提交 2010-07-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 2–9(8 aa) 片段:AMINO TERMINAL TAIL, RESIDUES 2-9
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;0.2M K2SO4 20 % PEG 3350, pH 8.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.235
2XL3 WDR5 IN COMPLEX WITH AN RBBP5 PEPTIDE AND HISTONE H3 PEPTIDE 提交 2010-07-19 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 2–9(8 aa) 片段:AMINO TERMINAL TAIL, RESIDUES 2-9
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;0.2M K2SO4 20 % PEG 3350, pH 8.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.235
5B1M The mouse nucleosome structure containing H3.1 提交 2015-12-08 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 A 1–136(136 aa)
链 E 1–136(136 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.34 Å R-free 0.259
5IX1 Crystal structure of mouse Morc3 ATPase-CW cassette in complex with AMPPNP and H3K4me3 peptide 提交 2016-03-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 P 2–16(15 aa)
链 Q 2–16(15 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;5% ethanol, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M HEPES-Na
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
5IX2 Crystal structure of mouse Morc3 ATPase-CW cassette in complex with AMPPNP and unmodified H3 peptide 提交 2016-03-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 P 2–33(32 aa)
链 Q 2–33(32 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;5% ethanol, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M HEPES-Na
分辨率 2.90 Å R-free 0.236
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 14–32(19 aa)
链 F 14–32(19 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl
分辨率 2.54 Å R-free 0.255
7OS4 Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-31 K18 提交 2021-06-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 14–32(19 aa)
链 H 14–32(19 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;1.2M Sodium malonate 0.1M MES pH 5.5 0.2M NaCl
分辨率 2.54 Å R-free 0.255