当前蛋白身份：P77444
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1C0N CSDB PROTEIN, NIFS HOMOLOGUE 提交 1999-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；sodium acetate, pottasium phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.239 |
| 1JF9 Crystal Structure of selenocysteine lyase 提交 2001-06-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；4M NACL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.207 |
| 1KMJ E. coli NifS/CsdB protein at 2.0A with the cysteine persulfide intermediate (residue CSS). 提交 2001-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；4M NACL, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 1KMK E. coli NifS/CsdB protein at 2.20A with the cysteine perselenide intermediate (residue CSZ). 提交 2001-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SEC SELENOCYSTEINE × 2 PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；4M NACL, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 5DB5 Crystal structure of PLP-bound E. coli SufS (cysteine persulfide intermediate) in space group P21 提交 2015-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
链 B
1–406（406 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CYS CYSTEINE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1:1 or 1:2 protein to reservoir solution (4% PEG3350, 200 mM ammonium citrate), crystals grown over 3 days, cryoprotectant: reservoir solution + 10% PEG400
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分辨率 2.75 Å R-free 0.217 |
| 6MR2 E. coli cysteine desulfurase SufS with a cysteine persulfide intermediate 提交 2018-10-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.191 |
| 6MR6 E. coli cysteine desulfurase SufS H55A with a cysteine persulfide intermediate 提交 2018-10-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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突变：H55A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
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分辨率 2.02 Å R-free 0.202 |
| 6MRE E. coli cysteine desulfurase SufS R92A with a cysteine persulfide intermediate 提交 2018-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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突变：R92A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
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分辨率 2.50 Å R-free 0.199 |
| 6MRH E. coli cysteine desulfurase SufS E96A with a cysteine persulfide intermediate 提交 2018-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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突变：E96A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
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分辨率 2.02 Å R-free 0.212 |
| 6MRI E. coli cysteine desulfurase SufS E250A with a cysteine persulfide intermediate 提交 2018-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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突变：E250A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.220 |
| 6O10 E. coli cysteine desulfurase SufS 提交 2019-02-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
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未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.204 |
| 6O11 E. coli cysteine desulfurase SufS C364A with a Cys-aldimine intermediate 提交 2019-02-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
|
突变：C364A | CL CHLORIDE ION × 2 C6P N-({3-HYDROXY-2-METHYL-5-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]PYRIDIN-4-YL}METHYL)-L-CYSTEINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20-30% w/v PEG3350, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
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分辨率 1.84 Å R-free 0.216 |
| 6O12 E. coli cysteine desulfurase SufS H123A 提交 2019-02-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
|
突变：H123A | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.216 |
| 6O13 E. coli cysteine desulfurase SufS H123A with a Cys-ketimine intermediate 提交 2019-02-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
|
突变：H123A | CKT Cys-ketimine × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M sodium chloride, 100 mM MES
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.199 |
| 6UY5 E. coli cysteine desulfurase SufS with a spontaneously rotated beta-hairpin 提交 2019-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
链 B
1–406（406 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M MgCl2, 0.1M Bis-Tris HCl pH 5.5, 23.3% w/v PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.221 |
| 8VBS E. coli cysteine desulfurase SufS bound to SufE C51A 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
链 B
1–406（406 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；24.5-31.5% w/v PEG2000 MME, 0.1 M KSCN
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.272 |
| 9D2D E. coli cysteine desulfurase SufS R359A 提交 2024-08-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–406（406 aa）
|
突变：R359A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；4-4.5 M NaCl, 100 mM MES pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |