当前蛋白身份：P78423
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B2T SOLUTION STRUCTURE OF THE CX3C CHEMOKINE DOMAIN OF FRACTALKINE 提交 1998-12-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
25–100（76 aa）
片段：CHEMOKINE DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；295.5 K；压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1F2L CRYSTAL STRUCTURE OF CHEMOKINE DOMAIN OF FRACTALKINE 提交 2000-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–100（76 aa）
片段：CHEMOKINE DOMAIN
链 B
25–100（76 aa）
片段：CHEMOKINE DOMAIN
链 C
25–100（76 aa）
片段：CHEMOKINE DOMAIN
链 D
25–100（76 aa）
片段：CHEMOKINE DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；sodium formate, disodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.321 |
| 4XT1 Structure of a nanobody-bound viral GPCR bound to human chemokine CX3CL1 提交 2015-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
25–101（77 aa）
片段：UNP residues 25-101
|
突变：N9A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CLR CHOLESTEROL × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 UNL UNKNOWN LIGAND × 7 SIN SUCCINIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.3；293 K；PEG 300, MES, sodium succinate, polypropylene glycol 400
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.249 |
| 4XT3 Structure of a viral GPCR bound to human chemokine CX3CL1 提交 2015-01-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
25–101（77 aa）
片段：UNP residues 25-101
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UNL UNKNOWN LIGAND × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.4；293 K；PEG 300, HEPES, ammonium phosphate
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.322 |
| 7RKF Structure of CX3CL1-US28-G11iN18-scFv16 in TL-state 提交 2021-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 L
25–101（77 aa）
片段：UNP residues 25-101
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1 s blotting before plunging
|
分辨率 4.00 Å |
| 7RKM Structure of CX3CL1-US28-Gi-scFv16 in C-state 提交 2021-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 L
25–101（77 aa）
片段：UNP residues 25-101
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1 s blotting before plunging
|
分辨率 3.50 Å |
| 7RKN Structure of CX3CL1-US28-Gi-scFv16 in OC-state 提交 2021-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 L
25–101（77 aa）
片段：UNP residues 25-101
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1 s blotting before plunging
|
分辨率 3.60 Å |
| 7XBX Cryo-EM structure of the human chemokine receptor CX3CR1 in complex with CX3CL1 and Gi1 提交 2022-03-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
25–100（76 aa）
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突变：G35C,I222L,L278C,C323S,M352V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |