当前蛋白身份：P80379
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EMW SOLUTION STRUCTURE OF THE RIBOSOMAL PROTEIN S16 FROM THERMUS THERMOPHILUS 提交 2000-03-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–67（67 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2 M LiCl；压力 ambient
NMR样品组成
S16; U-15N,13C; 50mM phosphate buffer; 200 mM LiCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.2 mM S16; U-15N; 50mM phosphate buffer; 200 mM LiCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.6 mM S16; 50mM phosphate buffer; 200 mM LiCl | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 1J5E Structure of the Thermus thermophilus 30S Ribosomal Subunit 提交 2002-04-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 188 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
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分辨率 3.05 Å R-free 0.252 |
| 1N32 Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit bound to codon and near-cognate transfer RNA anticodon stem-loop mismatched at the first codon position at the a site with paromomycin 提交 2002-10-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 158 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, potassium-MES, sodium cacodylate,
PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
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分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 1N33 Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit bound to codon and near-cognate transfer rna anticodon stem-loop mismatched at the second codon position at the a site with paromomycin 提交 2002-10-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 106 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, potassium-MES, sodium cacodylate,
PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
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分辨率 3.35 Å R-free 0.284 |
| 1XMO Crystal Structure of mnm5U34t6A37-tRNALysUUU Complexed with AAG-mRNA in the Decoding Center 提交 2004-10-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 107 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, magnesium chloride, potassium chloride, ammonium chloride, MES-KOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.K
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分辨率 3.25 Å R-free 0.284 |
| 1XMQ Crystal Structure of t6A37-ASLLysUUU AAA-mRNA Bound to the Decoding Center 提交 2004-10-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 107 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, magnesium chloride, potassium chloride, ammonium chloride, MES-KOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.K
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分辨率 3.00 Å R-free 0.236 |
| 1XNQ Structure of an Inosine-Adenine Wobble Base Pair Complex in the Context of the Decoding Center 提交 2004-10-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 107 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, magnesium chloride, potassium chloride, ammonium chloride, MES-KOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.K
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分辨率 3.05 Å R-free 0.270 |
| 1XNR Crystal Structure of an Inosine-Cytosine Wobble Base Pair in the Context of the Decoding Center 提交 2004-10-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 108 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, magnesium chloride, potassium chloride, ammonium chloride, MES-KOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.273 |
| 3OTO Crystal Structure of the 30S ribosomal subunit from a KsgA mutant of Thermus thermophilus (HB8) 提交 2010-09-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 94 K POTASSIUM ION × 42 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 6.5；277 K；pH 6.5, hanging drop, temperature 277K
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分辨率 3.69 Å R-free 0.231 |
| 4AQY Structure of ribosome-apramycin complexes 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–88（88 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 203 K POTASSIUM ION × 15 AM2 APRAMYCIN × 5 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；MPD, NH4CL, KCL, CACL2, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
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分辨率 3.50 Å R-free 0.235 |
| 4V5L The structure of EF-Tu and aminoacyl-tRNA bound to the 70S ribosome with a GTP analog 提交 2010-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 AP
1–17（17 aa）
片段：RESIDUES 1-17 AND 21-91
链 AP
21–91（71 aa）
片段：RESIDUES 1-17 AND 21-91
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；100 MM MES PH 6.3, 60-100 MM KCL, 50 MM SUCROSE, 1% GLYCEROL, AND 5.3% (W/V) PEG20K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.268 |