当前蛋白身份：P81288
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1C05 SOLUTION STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEIN S4 DELTA 41, REFINED WITH DIPOLAR COUPLINGS (MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE) 提交 1999-07-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
41–198（158 aa）
片段：S4 DELTA 41 (S4 RESIDUES 42-200)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.4；310 K；离子强度（mmCIF原始值）250 mM KCl；压力 1
NMR测量条件
pH 6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）80 mM KCl；压力 1
NMR测量条件
pH 6.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）300 mM KCl；压力 1
NMR样品组成
1.1 mM S4 delta 41, U-15N,13C; 20 mM d4-acetate pH 5.4, 250 mM KCl, 0.1 mM sodium azide | 94% H2O, 6% D2O
NMR样品组成
0.8 mM S4 delta 41, U-15N; 20 mM d4-acetate pH 5.4, 250 mM KCl, 0.1 mM sodium azide | 94% H2O, 6% D2O
NMR样品组成
0.45 mM S4 delta 41, U-15N,13C; 20 mM d4-acetate pH 5.4, 250 mM KCl | 99.9% D2O
NMR样品组成
0.62 mM S4 delta 41, 10% 13C; 20 mM d4-acetate pH 5.4, 250 mM KCl | 99.9% D2O
NMR样品组成
0.10 mM S4 delta 41, U-15N; 7 mM d4-acetate pH 5.4, 7 mM KH2PO4 pH 6.5, 80 mM KCl, 5% w/v DMPC:DHPC (3:1) | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.21 mM S4 delta 41, U-15N, 85% 2H; 15N,13C,1H methionine; epsilon-13C, 1H tyrsoine; beta,gamma,delta 2H proline; 10 mM KH2PO4 pH 6.5, 300 mM KCl, 0.2 mM sodium azide, 2.5 mg/ml Pf1 | 94% H2O, 6% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1C06 SOLUTION STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEIN S4 DELTA 41, REFINED WITH DIPOLAR COUPLINGS (ENSEMBLE OF 16 STRUCTURES) 提交 1999-07-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
41–198（158 aa）
片段：S4 DELTA 41 (S4 RESIDUES 42-200)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.4；310 K；离子强度（mmCIF原始值）250 mM KCL；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）80 mM KCL；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 6.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）300 mM KCL；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.1 MM S4 DELTA 41, U-15N,13C; 20 MM D4-ACETATE PH 5.4, 250 MM KCL, 0.1 MM
SODIUM AZIDE | 94% H2O, 6% D2O
NMR样品组成
0.8 MM S4 DELTA 41, U-15N; 20 MM D4-ACETATE PH 5.4, 250 MM KCL, 0.1 MM SODIUM
AZIDE | 94% H2O, 6% D2O
NMR样品组成
0.45 MM S4 DELTA 41, U-15N,13C; 20 MM D4-ACETATE PH 5.4, 250 MM KCL | 99.9% D2O
NMR样品组成
0.62 MM S4 DELTA 41, 10% 13C; 20 MM D4-ACETATE PH 5.4, 250 MM KCL | 99.9% D2O
NMR样品组成
0.10 MM S4 DELTA 41, U-15N; 7 MM D4-ACETATE PH 5.4, 7 MM KH2PO4 PH 6.5, 80 MM
KCL, 5% W/V DMPC:DHPC (3:1) | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.21 MM S4 DELTA 41, U-15N, 85% 2H; 15N,13C,1H METHIONINE; EPSILON-13C,1H
TYROSINE; BETA,GAMMA,DELTA 2H PROLINE; 10 MM KH2PO4 PH 6.5, 300 MM KCL, 0.2 MM
SODIUM AZIDE, 2.5 MG/ML PF1 | 94% H2O, 6% D2O
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分辨率未提供 |
| 1EG0 FITTING OF COMPONENTS WITH KNOWN STRUCTURE INTO AN 11.5 A CRYO-EM MAP OF THE E.COLI 70S RIBOSOME 提交 2000-02-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 A
41–199（159 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM Hepes, 6 mM Mg(CH3COO)2 150 mM NH4Cl, 4 mM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 11.50 Å |
| 1QD7 PARTIAL MODEL FOR 30S RIBOSOMAL SUBUNIT 提交 1999-07-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
41–198（158 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；VAPOUR DIFFUSION AT 277 K, MPD, VAPOR DIFFUSION
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分辨率 5.50 Å |